Gene Details:

  • Gene ID: AT3G09090
  • Gene Symbol: DEX1
  • Gene Name: DEFECTIVE IN EXINE FORMATION 1
  • Description: defective in exine formation protein (DEX1);(source:Araport11)
  • TAIR Accession:
  • Genome: Araport11_genome_release
  • Species: Arabidopsis thaliana

Transcripts:

Germplasm Phenotype:

  • CS3827  — disruption of the plasma menbrane of microspores; blocks the normal invagination of the plasma menbrane and disrupts the proper deposition of sporopollenin during pollen wall development; plasma membrane irregular with flattened protuberances and rare invaginations; this mutation cause male sterility; kanamycin resistant.

Literature:

Sequence:

cDNA Sequence
  • >AT3G09090.2 CGGCAAGCAGTTTACTCTTCACAGCGTCATTCGATTTCGCCGGCTGCGATCTCCCACACACACAGAGTCTCAGCTTCGTCTCATTCTCCTTCTCGATCTCTCCTTTTTATTCACCATTCCAAATTCCCTAAACCCCGATTTTGGGGAGGTTTTACAAAATCTATCGACGTAGTTGGATACAGTTCTTCGATTCTGATTCGATTTTAATTTTATGTCAAGGGAATTTGCCTAGTATTCGCAGAGTGTGATCATATGAAATCTCGAGCGAGGCAGTGTCTGCTGGTTTGTTTGCTCTGTCTTTCCTTAACGAATCTCTCCTATGGAGAAAATAAGTTCAGAGAGCGTAAAGCCACCGATGACGAGCTGGGCTACCCCGATATTGATGAAGATGCTTTATTGAATACTCAGTGCCCGAAAAAATTGGAGCTGCGATGGCAAACTGAAGTCACTTCTAGCGTTTATGCTACACCCTTGATTGCTGATATTAACAGTGATGGAAAGCTTGACATTGTTGTTCCATCTTTTGTTCATTACCTCGAAGTTCTTGAAGGAGCTGATGGAGACAAGATGCCAGGTTGGCCTGCTTTTCACCAGTCAAATGTGCACTCGAGTCCTCTTCTATTTGATATCGACAAAGATGGTGTTAGAGAAATTGCTCTGGCTACCTACAATGCCGAAGTGCTCTTTTTCAGGGTATCAGGCTTTTTGATGTCAGATAAGCTAGAAGTGCCACGTAGAAAAGTGCACAAGAACTGGCATGTGGGACTTAATCCTGATCCTGTTGACCGTTCACATCCTGATGTTCATGATGATGTGCTTGAGGAGGAAGCTATGGCAATGAAGTCATCGACCACTCAAACGAATGCAACTACCACAACACCAAATGTTACAGTCTCGATGACCAAAGAAGTTCATGGCGCTAATTCATATGTGTCAACTCAAGAGGATCAAAAGAGACCAGAGAATAATCAAACAGAAGCTATTGTAAAGCCTACTCCAGAGCTACATAATTCCTCCATGGATGCTGGAGCAAATAATTTGGCAGCAAATGCTACTACAGCTGGCTCAAGAGAAAACCTCAATAGAAATGTAACCACCAATGAGGTGGATCAAAGCAAAATTAGTGGAGATAAGAATGAAACTGTTATTAAATTAAATACTAGTACGGGTAATTCCTCAGAAACTCTGGGGACATCTGGAAACAGTAGTACGGCAGAGACAGTAACCAAAAGTGGGAGGCGACTTCTGGAAGAGGATGGTTCGAAAGAATCTGTGGACAGCCATTCGGACAGTAAAGACAACAGTGAGGGTGTCCGCATGGCGACAGTAGAAAATGATGGAGGCTTAGAAGCTGACGCAGATTCATCGTTTGAGTTGTTGCGTGAGAATGATGAGTTAGCTGATGAATACAGTTATGATTATGACGATTATGTTGATGAGAAAATGTGGGGTGATGAGGAATGGGTTGAGGGGCAGCACGAGAACTCAGAAGATTATGTGAATATTGACGCCCATATACTATGCACTCCTGTAATTGCTGACATAGACAAAGATGGAGTACAGGAGATGATTGTTGCTGTTTCCTATTTCTTCGACCCCGAGTACTATGATAATCCAGAACATCTGAAAGAGCTTGGTGGTATCGACATTAAAAATTATATTGCTAGTTCAATTGTGGTTTTCAATCTTGATACTAAACAAGTCAAGTGGATCAAAGAGCTAGATTTGAGTACGGATAAAGCAAACTTCCGTGCTTATATTTATTCTTCACCAACGGTTGTTGATTTGGATGGCGATGGTTATTTGGATATCCTTGTCGGAACTTCCTTTGGCTTATTCTACGCCATGGATCATCGTGGAAACATCAGAGAAAAATTCCCACTGGAAATGGCTGAAATTCAAGGAGCAGTGGTTGCGGCCGACATAAATGATGATGGAAAGATTGAACTTGTAACTACTGATTCACACGGAAATATAGCAGCATGGACCACCCAAGGAGTGGAAATTTGGGAAGCACATCTTAAGAGCCTTGTTCCCCAGGGTCCTTCTATAGGCGATGTTGATGGTGACGGACACACGGAGGTTGTGGTTCCTACATCATCAGGAAACATATACGTTCTTAGTGGCAAGGATGGTTCTATTGTCCGTCCTTACCCATACAGGACTCATGGAAGAGTGATGAACCAACTTCTTCTTGTTGATCTGAACAAGCGAGGTGAGAAAAAGAAGGGTCTCACCATCGTTACTACATCCTTTGACGGTTACCTGTATCTCATAGATGGACCCACCTCGTGCACTGACGTTGTTGACATTGGCGAAACTTCATACAGCATGGTCTTGGCTGATAATGTTGACGGTGGAGATGATCTCGATCTTATTGTCTCAACTATGAATGGAAACGTCTTTTGCTTCTCAACGCCTTCTCCTCACCATCCCCTTAAGGCTTGGAGATCTAGTGATCAAGGCAGGAACAATAAGGCCAATCGTTATGATCGTGAAGGCGTTTTTGTCACGCATTCGACCAGAGGTTTCCGTGATGAGGAAGGCAAAAACTTCTGGGCTGAGATCGAGATCGTTGATAAATATAGATATCCATCTGGTTCACAAGCACCCTACAACGTTACTCTGTTTTCAAATACAGACGACGCTGTTGGTTCCAGGCAATTACCAGGGAGAGAGGAGGATAACGCAGAGCCAGATCTATGACCGCCCTGGAAAATACCGGATAAAACTACCAACTGTGGGAGTGAGAACAACAGGAACTGTAATGGTGGAGATGGCAGATAAGAATGGACTCCATTTCTCAGACGAATTCTCACTAACTTTCCATATGTATTACTACAAGCTTCTGAAATGGCTTCTTGTTCTCCCGATGCTCGGGATGTTCGGTCTGCTCGTGATACTACGGCCTCAAGAAGCCGTGCCTCTCCCGTCTTTTTCCCGCAACACAGATTTATGATACTAGGTACCATCTGTAAACAGGAGGTACACATCCTCATAGAGCTCATCAAAAGGATCCAGGGACAATTTCGTGCTAGAGTTTTCGATTTCTGTACCTTTTTAAAATGTAATTCGACTTTAGTATTAGATCAACTCTTTTCTGAGTTTATAAAGTTTTTGCACAACTTAATTTCTTGAGAATTTATGTTTTGTTCATACGAAATTTGAATTTG
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  • >AT3G09090.1 CGGCAAGCAGTTTACTCTTCACAGCGTCATTCGATTTCGCCGGCTGCGATCTCCCACACACACAGAGTCTCAGCTTCGTCTCATTCTCCTTCTCGATCTCTCCTTTTTATTCACCATTCCAAATTCCCTAAACCCCGATTTTGGGGAGGTTTTACAAAATCTATCGACGTAGTTGGATACAGTTCTTCGATTCTGATTCGATTTTAATTTTATGTCAAGGGAATTTGCCTAGTATTCGCAGAGTGTGATCATATGAAATCTCGAGCGAGGCAGTGTCTGCTGGTTTGTTTGCTCTGTCTTTCCTTAACGAATCTCTCCTATGGAGAAAATAAGTTCAGAGAGCGTAAAGCCACCGATGACGAGCTGGGCTACCCCGATATTGATGAAGATGCTTTATTGAATACTCAGTGCCCGAAAAAATTGGAGCTGCGATGGCAAACTGAAGTCACTTCTAGCGTTTATGCTACACCCTTGATTGCTGATATTAACAGTGATGGAAAGCTTGACATTGTTGTTCCATCTTTTGTTCATTACCTCGAAGTTCTTGAAGGAGCTGATGGAGACAAGATGCCAGGTTGGCCTGCTTTTCACCAGTCAAATGTGCACTCGAGTCCTCTTCTATTTGATATCGACAAAGATGGTGTTAGAGAAATTGCTCTGGCTACCTACAATGCCGAAGTGCTCTTTTTCAGGGTATCAGGCTTTTTGATGTCAGATAAGCTAGAAGTGCCACGTAGAAAAGTGCACAAGAACTGGCATGTGGGACTTAATCCTGATCCTGTTGACCGTTCACATCCTGATGTTCATGATGATGTGCTTGAGGAGGAAGCTATGGCAATGAAGTCATCGACCACTCAAACGAATGCAACTACCACAACACCAAATGTTACAGTCTCGATGACCAAAGAAGTTCATGGCGCTAATTCATATGTGTCAACTCAAGAGGATCAAAAGAGACCAGAGAATAATCAAACAGAAGCTATTGTAAAGCCTACTCCAGAGCTACATAATTCCTCCATGGATGCTGGAGCAAATAATTTGGCAGCAAATGCTACTACAGCTGGCTCAAGAGAAAACCTCAATAGAAATGTAACCACCAATGAGGTGGATCAAAGCAAAATTAGTGGAGATAAGAATGAAACTGTTATTAAATTAAATACTAGTACGGGTAATTCCTCAGAAACTCTGGGGACATCTGGAAACAGTAGTACGGCAGAGACAGTAACCAAAAGTGGGAGGCGACTTCTGGAAGAGGATGGTTCGAAAGAATCTGTGGACAGCCATTCGGACAGTAAAGACAACAGTGAGGGTGTCCGCATGGCGACAGTAGAAAATGATGGAGGCTTAGAAGCTGACGCAGATTCATCGTTTGAGTTGTTGCGTGAGAATGATGAGTTAGCTGATGAATACAGTTATGATTATGACGATTATGTTGATGAGAAAATGTGGGGTGATGAGGAATGGGTTGAGGGGCAGCACGAGAACTCAGAAGATTATGTGAATATTGACGCCCATATACTATGCACTCCTGTAATTGCTGACATAGACAAAGATGGAGTACAGGAGATGATTGTTGCTGTTTCCTATTTCTTCGACCCCGAGTACTATGATAATCCAGAACATCTGAAAGAGCTTGGTGGTATCGACATTAAAAATTATATTGCTAGTTCAATTGTGGTTTTCAATCTTGATACTAAACAAGTCAAGTGGATCAAAGAGCTAGATTTGAGTACGGATAAAGCAAACTTCCGTGCTTATATTTATTCTTCACCAACGGTTGTTGATTTGGATGGCGATGGTTATTTGGATATCCTTGTCGGAACTTCCTTTGGCTTATTCTACGCCATGGATCATCGTGGAAACATCAGAGAAAAATTCCCACTGGAAATGGCTGAAATTCAAGGAGCAGTGGTTGCGGCCGACATAAATGATGATGGAAAGATTGAACTTGTAACTACTGATTCACACGGAAATATAGCAGCATGGACCACCCAAGGAGTGGAAATTTGGGAAGCACATCTTAAGAGCCTTGTTCCCCAGGGTCCTTCTATAGGCGATGTTGATGGTGACGGACACACGGAGGTTGTGGTTCCTACATCATCAGGAAACATATACGTTCTTAGTGGCAAGGATGGTTCTATTGTCCGTCCTTACCCATACAGGACTCATGGAAGAGTGATGAACCAACTTCTTCTTGTTGATCTGAACAAGCGAGGTGAGAAAAAGAAGGGTCTCACCATCGTTACTACATCCTTTGACGGTTACCTGTATCTCATAGATGGACCCACCTCGTGCACTGACGTTGTTGACATTGGCGAAACTTCATACAGCATGGTCTTGGCTGATAATGTTGACGGTGGAGATGATCTCGATCTTATTGTCTCAACTATGAATGGAAACGTCTTTTGCTTCTCAACGCCTTCTCCTCACCATCCCCTTAAGGCTTGGAGATCTAGTGATCAAGGCAGGAACAATAAGGCCAATCGTTATGATCGTGAAGGCGTTTTTGTCACGCATTCGACCAGAGGTTTCCGTGATGAGGAAGGCAAAAACTTCTGGGCTGAGATCGAGATCGTTGATAAATATAGATATCCATCTGGTTCACAAGCACCCTACAACGTTACTCTGTTTTCAAATACAGACGACGCTGTTGGTTCCAGGCAATTACCAGGGAGAGAGGAGGATAACGCAGAGCCAGATCTATGACCGCCCTGGAAAATACCGGATAAAACTACCAACTGTGGGAGTGAGAACAACAGGAACTGTAATGGTGGAGATGGCAGATAAGAATGGACTCCATTTCTCAGACGAATTCTCACTAACTTTCCATATGTATTACTACAAGCTTCTGAAATGGCTTCTTGTTCTCCCGATGCTCGGGATGTTCGGTCTGCTCGTGATACTACGGCCTCAAGAAGCCGTGCCTCTCCCGTCTTTTTCCCGCAACACAGATTTATGATACTAGGTACCATCTGTAAACAGGAGGTACACATCCTCATAGAGCTCATCAAAAGGATCCAGGGACAATTTCGTGCTAGAGTTTTCGATTTCTGTACCTTTTTAAAATGTAATTCGACTTTAGTATTAGATCAACTCTTTTCTGAGTTTATAAAGTTTTTGCACAACTTAATTTCTTGAGAATTTATGTTTTGTTCATACGAAATTTGAATTTG
CDS Sequence
  • >AT3G09090.2 ATGAAATCTCGAGCGAGGCAGTGTCTGCTGGTTTGTTTGCTCTGTCTTTCCTTAACGAATCTCTCCTATGGAGAAAATAAGTTCAGAGAGCGTAAAGCCACCGATGACGAGCTGGGCTACCCCGATATTGATGAAGATGCTTTATTGAATACTCAGTGCCCGAAAAAATTGGAGCTGCGATGGCAAACTGAAGTCACTTCTAGCGTTTATGCTACACCCTTGATTGCTGATATTAACAGTGATGGAAAGCTTGACATTGTTGTTCCATCTTTTGTTCATTACCTCGAAGTTCTTGAAGGAGCTGATGGAGACAAGATGCCAGGTTGGCCTGCTTTTCACCAGTCAAATGTGCACTCGAGTCCTCTTCTATTTGATATCGACAAAGATGGTGTTAGAGAAATTGCTCTGGCTACCTACAATGCCGAAGTGCTCTTTTTCAGGGTATCAGGCTTTTTGATGTCAGATAAGCTAGAAGTGCCACGTAGAAAAGTGCACAAGAACTGGCATGTGGGACTTAATCCTGATCCTGTTGACCGTTCACATCCTGATGTTCATGATGATGTGCTTGAGGAGGAAGCTATGGCAATGAAGTCATCGACCACTCAAACGAATGCAACTACCACAACACCAAATGTTACAGTCTCGATGACCAAAGAAGTTCATGGCGCTAATTCATATGTGTCAACTCAAGAGGATCAAAAGAGACCAGAGAATAATCAAACAGAAGCTATTGTAAAGCCTACTCCAGAGCTACATAATTCCTCCATGGATGCTGGAGCAAATAATTTGGCAGCAAATGCTACTACAGCTGGCTCAAGAGAAAACCTCAATAGAAATGTAACCACCAATGAGGTGGATCAAAGCAAAATTAGTGGAGATAAGAATGAAACTGTTATTAAATTAAATACTAGTACGGGTAATTCCTCAGAAACTCTGGGGACATCTGGAAACAGTAGTACGGCAGAGACAGTAACCAAAAGTGGGAGGCGACTTCTGGAAGAGGATGGTTCGAAAGAATCTGTGGACAGCCATTCGGACAGTAAAGACAACAGTGAGGGTGTCCGCATGGCGACAGTAGAAAATGATGGAGGCTTAGAAGCTGACGCAGATTCATCGTTTGAGTTGTTGCGTGAGAATGATGAGTTAGCTGATGAATACAGTTATGATTATGACGATTATGTTGATGAGAAAATGTGGGGTGATGAGGAATGGGTTGAGGGGCAGCACGAGAACTCAGAAGATTATGTGAATATTGACGCCCATATACTATGCACTCCTGTAATTGCTGACATAGACAAAGATGGAGTACAGGAGATGATTGTTGCTGTTTCCTATTTCTTCGACCCCGAGTACTATGATAATCCAGAACATCTGAAAGAGCTTGGTGGTATCGACATTAAAAATTATATTGCTAGTTCAATTGTGGTTTTCAATCTTGATACTAAACAAGTCAAGTGGATCAAAGAGCTAGATTTGAGTACGGATAAAGCAAACTTCCGTGCTTATATTTATTCTTCACCAACGGTTGTTGATTTGGATGGCGATGGTTATTTGGATATCCTTGTCGGAACTTCCTTTGGCTTATTCTACGCCATGGATCATCGTGGAAACATCAGAGAAAAATTCCCACTGGAAATGGCTGAAATTCAAGGAGCAGTGGTTGCGGCCGACATAAATGATGATGGAAAGATTGAACTTGTAACTACTGATTCACACGGAAATATAGCAGCATGGACCACCCAAGGAGTGGAAATTTGGGAAGCACATCTTAAGAGCCTTGTTCCCCAGGGTCCTTCTATAGGCGATGTTGATGGTGACGGACACACGGAGGTTGTGGTTCCTACATCATCAGGAAACATATACGTTCTTAGTGGCAAGGATGGTTCTATTGTCCGTCCTTACCCATACAGGACTCATGGAAGAGTGATGAACCAACTTCTTCTTGTTGATCTGAACAAGCGAGGTGAGAAAAAGAAGGGTCTCACCATCGTTACTACATCCTTTGACGGTTACCTGTATCTCATAGATGGACCCACCTCGTGCACTGACGTTGTTGACATTGGCGAAACTTCATACAGCATGGTCTTGGCTGATAATGTTGACGGTGGAGATGATCTCGATCTTATTGTCTCAACTATGAATGGAAACGTCTTTTGCTTCTCAACGCCTTCTCCTCACCATCCCCTTAAGGCTTGGAGATCTAGTGATCAAGGCAGGAACAATAAGGCCAATCGTTATGATCGTGAAGGCGTTTTTGTCACGCATTCGACCAGAGGTTTCCGTGATGAGGAAGGCAAAAACTTCTGGGCTGAGATCGAGATCGTTGATAAATATAGATATCCATCTGGTTCACAAGCACCCTACAACGTTACTCTGTTTTCAAATACAGACGACGCTGTTGGTTCCAGGCAATTACCAGGGAGAGAGGAGGATAACGCAGAGCCAGATCTATGA
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Protein Sequence
  • >AT3G09090.2 MKSRARQCLLVCLLCLSLTNLSYGENKFRERKATDDELGYPDIDEDALLNTQCPKKLELRWQTEVTSSVYATPLIADINSDGKLDIVVPSFVHYLEVLEGADGDKMPGWPAFHQSNVHSSPLLFDIDKDGVREIALATYNAEVLFFRVSGFLMSDKLEVPRRKVHKNWHVGLNPDPVDRSHPDVHDDVLEEEAMAMKSSTTQTNATTTTPNVTVSMTKEVHGANSYVSTQEDQKRPENNQTEAIVKPTPELHNSSMDAGANNLAANATTAGSRENLNRNVTTNEVDQSKISGDKNETVIKLNTSTGNSSETLGTSGNSSTAETVTKSGRRLLEEDGSKESVDSHSDSKDNSEGVRMATVENDGGLEADADSSFELLRENDELADEYSYDYDDYVDEKMWGDEEWVEGQHENSEDYVNIDAHILCTPVIADIDKDGVQEMIVAVSYFFDPEYYDNPEHLKELGGIDIKNYIASSIVVFNLDTKQVKWIKELDLSTDKANFRAYIYSSPTVVDLDGDGYLDILVGTSFGLFYAMDHRGNIREKFPLEMAEIQGAVVAADINDDGKIELVTTDSHGNIAAWTTQGVEIWEAHLKSLVPQGPSIGDVDGDGHTEVVVPTSSGNIYVLSGKDGSIVRPYPYRTHGRVMNQLLLVDLNKRGEKKKGLTIVTTSFDGYLYLIDGPTSCTDVVDIGETSYSMVLADNVDGGDDLDLIVSTMNGNVFCFSTPSPHHPLKAWRSSDQGRNNKANRYDREGVFVTHSTRGFRDEEGKNFWAEIEIVDKYRYPSGSQAPYNVTLFSNTDDAVGSRQLPGREEDNAEPDL
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