Gene Details:

  • Gene ID: AT3G16890
  • Gene Symbol: PPR40
  • Gene Name: pentatricopeptide (PPR) domain protein 40
  • Description: pentatricopeptide (PPR) domain protein 40;(source:Araport11)
  • TAIR Accession: locus:2086032
  • Genome: Araport11_genome_release
  • Species: Arabidopsis thaliana

Transcripts:

Gene Ontology:

  • GO:0042775  — acts upstream of or within — mitochondrial ATP synthesis coupled electron transport
  • GO:0005739  — located in — mitochondrion
  • GO:0009737  — acts upstream of or within — response to abscisic acid
  • GO:0006397  — involved in — mRNA processing
  • GO:0003729  — enables — mRNA binding
  • GO:0006979  — acts upstream of or within — response to oxidative stress
  • GO:0005737  — is active in — cytoplasm
  • GO:0009651  — acts upstream of or within — response to salt stress

Germplasm Phenotype:

  • SALK_071712  — semi-dwarf; enhanced sensitivity to salt, ABA and oxidative stress; reduced electron transport through Complex III (cytochrome c reductase).
  • ppr40-1  — semi-dwarf; enhanced sensitivity to salt, ABA and oxidative stress; reduced electron transport through Complex III (cytochrome c reductase).

Literature:

Sequence:

cDNA Sequence
  • >AT3G16890.2 ACACATATTGATATTGGTGTATTAAACAGCGTCGTTTAGGAAACATCGTCTTGAGGTTAGAGACCAAATCAATGTTTCACTTGCACTCAGCTCCGTTCTGGTCACGACATGAGAGGCTTTGCTTCTTCAGCATCTAGAATAGCGACGGCGGCAGCAGCTTCCAAATCACTAAACGCTTCCACATCCGTAAACCCTAAGCTCTCAAAAACCCTAAACTCTTCAGCGTTTTGCAGAATCAAGACAACCCATTACACTCCCTGCGATTTTACCTCTGGGTCTCCAACTTCGACCCGGTTTACGCTAAGGATCAGTCTCTGAAGAGTGTTCTAGGGAACGCACTTTTTCGTAAAGGCCCCTTATTGTTGTCTATGGAATTGCTTAAAGAGATTAGAGATTCAGGGTATCGGATTAGTGATGAATTGATGTGTGTTTTGATCGGAAGCTGGGGAAGATTAGGTTTAGCTAAGTACTGTAATGATGTTTTTGCTCAGATATCTTTTCTTGGAATGAAACCAAGTACAAGGCTTTATAATGCTGTGATTGATGCGTTGGTGAAGTCTAATTCACTTGATTTGGCTTACCTCAAGTTTCAGCAGATGCGTAGTGATGGCTGTAAACCGGATCGGTTTACCTATAATATACTTATACATGGTGTTTGCAAGAAGGGTGTGGTTGATGAAGCTATTCGATTGGTTAAACAGATGGAACAGGAAGGGAATAGACCCAATGTGTTCACATACACGATTTTGATCGACGGGTTTTTGATAGCAGGGAGGGTTGATGAGGCGTTGAAGCAATTGGAGATGATGCGGGTGAGAAAGTTGAATCCTAATGAAGCTACAATCAGAACTTTCGTACACGGGATTTTCCGTTGCTTGCCGCCGTGTAAAGCGTTTGAGGTTTTGGTTGGGTTTATGGAGAAAGACTCAAACTTGCAAAGAGTTGGTTACGATGCTGTGTTGTATTGTCTTTCAAACAACTCAATGGCTAAAGAGACTGGTCAATTCTTGAGGAAGATAGGTGAGAGAGGTTATATTCCGGATAGCTCAACATTCAATGCTGCGATGAGTTGTCTCCTAAAAGGGCATGATCTTGTTGAGACTTGTAGGATATTTGACGGTTTTGTCAGCCGTGGAGTTAAGCCAGGATTCAATGGTTATCTTGTGTTAGTTCAAGCTCTGTTGAATGCTCAGAGGTTCTCTGAAGGTGACCGGTATCTGAAACAAATGGGTGTTGACGGGCTTCTATCAAGTGTATATAGTTATAATGCGGTAATTGACTGTCTCTGCAAGGCTCGACGCATAGAGAATGCAGCTATGTTCTTAACAGAGATGCAGGATAGAGGTATTTCTCCGAATCTCGTAACTTTCAATACCTTTCTGAGCGGTTATAGCGTGAGGGGTGATGTAAAGAAGGTTCACGGCGTGCTAGAGAAGCTTCTTGTACATGGTTTCAAACCAGACGTGATCACTTTCAGTTTGATCATAAACTGTCTTTGCAGAGCAAAAGAAATTAAAGATGCATTTGACTGTTTCAAGGAGATGTTGGAATGGGGTATTGAGCCAAACGAGATCACATACAATATCTTGATTCGCTCCTGTTGTTCCACCGGAGATACCGATAGATCAGTGAAGCTGTTTGCGAAGATGAAGGAAAACGGGTTAAGTCCAGACCTTTATGCGTACAATGCGACTATTCAGAGTTTTTGCAAGATGAGAAAGGTTAAGAAGGCTGAGGAATTGCTTAAAACAATGCTGAGAATTGGTTTGAAACCAGATAACTTTACATATAGCACTCTCATCAAAGCTCTAAGTGAATCTGGAAGAGAGAGTGAAGCAAGAGAGATGTTCAGTTCAATCGAAAGACATGGATGTGTTCCAGATTCATATACTAAGCGTCTTGTTGAAGAACTTGACCTAAGAAAAAGTGGACTCTCGAGAGAAACCGTGTCAGCCTCATAGAAATTGAATCCTCGAGAGTGTGAATATCCTATGAAGGCTTAGAAACCGGAAAAGTGGGTTCGTTTCATTTGGAAATGTCTGAGAAAGAACCCGATCTTTGCCACGGGTTGCCTCTTTGATGCAGACGGAAGAGAAACAGAACATGAGTGCAAAATGCAGAACAGAGTATTAAGTTTTGTTCTTTTGATTGATCAAAGCTTTTATATATTTCTGAGTCCGAGAAAGTGGCGGCAATAGTAATGGCAGTTGGTTGGTACTTGACAGTCAAAAGGCAAAAGATTTTGTATGTTTAGCACTAGATAGCCTTGGCCCTAATTTATACCCTTACCGTGTAACAGTTTAGGAAACAACAGTTTTGCCAGATTATATTGGACATGAGTATTGAATGATTTTGTTGTTTC
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CDS Sequence
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Protein Sequence
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  • >AT3G16890.1 MELLKEIRDSGYRISDELMCVLIGSWGRLGLAKYCNDVFAQISFLGMKPSTRLYNAVIDALVKSNSLDLAYLKFQQMRSDGCKPDRFTYNILIHGVCKKGVVDEAIRLVKQMEQEGNRPNVFTYTILIDGFLIAGRVDEALKQLEMMRVRKLNPNEATIRTFVHGIFRCLPPCKAFEVLVGFMEKDSNLQRVGYDAVLYCLSNNSMAKETGQFLRKIGERGYIPDSSTFNAAMSCLLKGHDLVETCRIFDGFVSRGVKPGFNGYLVLVQALLNAQRFSEGDRYLKQMGVDGLLSSVYSYNAVIDCLCKARRIENAAMFLTEMQDRGISPNLVTFNTFLSGYSVRGDVKKVHGVLEKLLVHGFKPDVITFSLIINCLCRAKEIKDAFDCFKEMLEWGIEPNEITYNILIRSCCSTGDTDRSVKLFAKMKENGLSPDLYAYNATIQSFCKMRKVKKAEELLKTMLRIGLKPDNFTYSTLIKALSESGRESEAREMFSSIERHGCVPDSYTKRLVEELDLRKSGLSRETVSAS