Gene Details:
- Gene ID: AT3G28550
- Gene Symbol: EXT16
- Gene Name: extensin 16
- Description: Proline-rich extensin-like family protein;(source:Araport11)
- TAIR Accession:
- Genome: Araport11_genome_release
- Species: Arabidopsis thaliana
Transcripts:
Literature:
- Self-rescue of an EXTENSIN mutant reveals alternative gene expression programs and candidate proteins for new cell wall assembly in Arabidopsis. DOI: 10.1111/tpj.12204 ; PMID: 23578334
Sequence:
cDNA Sequence
- >AT3G28550.2 GAAAATCTTTGCTATATAAACCTCAGCACTCATTCTTTAAAATACAAACCAAAACAAGAAATACTTTGCCAATGATATCTTCTTCTAAAATGGGGCCTTCTGCCCATCTCGTCTACGCTATAGGAGTTATCATCATGGCAACAATGGTTGCGGCATATGAGCCATACACAGATAGCTCACCTCCACCATACTCTGTGCCACTTCCCAAAGTGGAATACAAATCTCCTCCATTACCAGATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCACTAGAATACTCTCCAGCGCCTAAAGTTGATTATAAATCTCCACCACCACCATACTATTCACCATCTCCTAAAGTTGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCATCCCCAAAGGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCGCCACCACCACCAATCTATTCACCATCTCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTATTCGCCATCCCCTAAGGTGGAGTACAAATCTCCACCATCACCGTATGTTTACAACTCTCCACCACCATCATATTATTCACCATCCCCTAAGGTAGATTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTTTATAGTTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCATCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCTCCATCCCCTAAGGTTGTATACAAGTCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTACTCACCAACCCCGAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCACCATCACCTAAGGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCTCCTAAGATAGTCTACAAATCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCCCCACCACCCCCATACTACACACCTTCACCAAAGGTTGTATACAAGTCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTACTCACCATCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCTCCACCACCATACTACTCGCCATCTCCAAAGGTTGTATACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCTCCACCACCATACTATTCACCATCCCCTAAGGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTACTCTCCTTCACCAAAGGTTTTATACAAGTCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCTCCTTCTCCTAAGGTAGTCTACAAGTCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCTCCTTCTCCTAAAGTAGTTTACAAGTCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAAGTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCGTACGTCTATAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCGAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGCTCACCCCCACCACCATACTACTCACCTGCCCCTAAGGTAGATTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTATAGTTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTTGACTACAAATCTCCTCCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTTGACTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATCATACTCACCTTCTCCAAAAACTGAGTACTAAGCTTCACATTCACCTTCGTATTACTTGAAATTGTAATGAGATTCTTATATAAGCTACCAAGTTTTATTTCATTTCATCTTTGCTTTTGTTCTTCATGATATTCATATCTAATAAATTTTAATTCTGCCTATTTGATTAAATATTTTGCTTCAAAATCTTCAAATGGTTTAATGCTTTTACTTTTATTTGTTTTAAGTTTGCTTGCAATCTATATGAAGTTCTTTGCAAATTTGAATTACGTAGTTCACATTCTTGACTTTGTAGCTTTAGATAATTATGTAATCTTATAACATGGGACATGTTTATGGACT
- >AT3G28550.1 GAAAATCTTTGCTATATAAACCTCAGCACTCATTCTTTAAAATACAAACCAAAACAAGAAATACTTTGCCAATGATATCTTCTTCTAAAATGGGGCCTTCTGCCCATCTCGTCTACGCTATAGGAGTTATCATCATGGCAACAATGGTTGCGGCATATGAGCCATACACAGATAGCTCACCTCCACCATACTCTGTGCCACTTCCCAAAGTGGAATACAAATCTCCTCCATTACCAGATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCACTAGAATACTCTCCAGCGCCTAAAGTTGATTATAAATCTCCACCACCACCATACTATTCACCATCTCCTAAAGTTGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCATCCCCAAAGGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCGCCACCACCACCAATCTATTCACCATCTCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTATTCGCCATCCCCTAAGGTGGAGTACAAATCTCCACCATCACCGTATGTTTACAACTCTCCACCACCATCATATTATTCACCATCCCCTAAGGTAGATTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTTTATAGTTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCATCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCTCCATCCCCTAAGGTTGTATACAAGTCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTACTCACCAACCCCGAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCACCATCACCTAAGGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCTCCTAAGATAGTCTACAAATCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCCCCACCACCCCCATACTACACACCTTCACCAAAGGTTGTATACAAGTCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTACTCACCATCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCTCCACCACCATACTACTCGCCATCTCCAAAGGTTGTATACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCTCCACCACCATACTATTCACCATCCCCTAAGGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTACTCTCCTTCACCAAAGGTTTTATACAAGTCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCTCCTTCTCCTAAGGTAGTCTACAAGTCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCTCCTTCTCCTAAAGTAGTTTACAAGTCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAAGTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCGTACGTCTATAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCGAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGCTCACCCCCACCACCATACTACTCACCTGCCCCTAAGGTAGATTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTATAGTTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTTGACTACAAATCTCCTCCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTTGACTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATCATACTCACCTTCTCCAAAAACTGAGTACTAAGCTTCACATTCACCTTCGTATTACTTGAAATTGTAATGAGATTCTTATATAAGCTACCAAGTTTTATTTCATTTCATCTTTGCTTTTGTTCTTCATGATATTCATATCTAATAAATTTTAATTCTGCCTATTTGATTAAATATTTTGCTTCAAAATCTTCAAATGGTTTAATGCTTTTACTTTTATTTGTTTTAAGTTTGCTTGCAATCTATATGAAGTTCTTTGCAAATTTGAATTACGTAGTTCACATTCTTGACTTTGTAGCTTTAGATAATTATGTAATCTTATAACATGGGACATGTTTATGGACT
CDS Sequence
- >AT3G28550.2 ATGATATCTTCTTCTAAAATGGGGCCTTCTGCCCATCTCGTCTACGCTATAGGAGTTATCATCATGGCAACAATGGTTGCGGCATATGAGCCATACACAGATAGCTCACCTCCACCATACTCTGTGCCACTTCCCAAAGTGGAATACAAATCTCCTCCATTACCAGATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCACTAGAATACTCTCCAGCGCCTAAAGTTGATTATAAATCTCCACCACCACCATACTATTCACCATCTCCTAAAGTTGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCATCCCCAAAGGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCGCCACCACCACCAATCTATTCACCATCTCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTATTCGCCATCCCCTAAGGTGGAGTACAAATCTCCACCATCACCGTATGTTTACAACTCTCCACCACCATCATATTATTCACCATCCCCTAAGGTAGATTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTTTATAGTTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCATCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCTCCATCCCCTAAGGTTGTATACAAGTCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTACTCACCAACCCCGAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCACCATCACCTAAGGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCTCCTAAGATAGTCTACAAATCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCCCCACCACCCCCATACTACACACCTTCACCAAAGGTTGTATACAAGTCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTACTCACCATCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCTCCACCACCATACTACTCGCCATCTCCAAAGGTTGTATACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCTCCACCACCATACTATTCACCATCCCCTAAGGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTACTCTCCTTCACCAAAGGTTTTATACAAGTCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCTCCTTCTCCTAAGGTAGTCTACAAGTCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCTCCTTCTCCTAAAGTAGTTTACAAGTCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAAGTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCGTACGTCTATAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCGAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGCTCACCCCCACCACCATACTACTCACCTGCCCCTAAGGTAGATTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTATAGTTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTTGACTACAAATCTCCTCCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTTGACTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATCATACTCACCTTCTCCAAAAACTGAGTACTAA
- >AT3G28550.1 ATGATATCTTCTTCTAAAATGGGGCCTTCTGCCCATCTCGTCTACGCTATAGGAGTTATCATCATGGCAACAATGGTTGCGGCATATGAGCCATACACAGATAGCTCACCTCCACCATACTCTGTGCCACTTCCCAAAGTGGAATACAAATCTCCTCCATTACCAGATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCACTAGAATACTCTCCAGCGCCTAAAGTTGATTATAAATCTCCACCACCACCATACTATTCACCATCTCCTAAAGTTGAGTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTCTACAACTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCATCCCCAAAGGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCGCCACCACCACCAATCTATTCACCATCTCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTATTCGCCATCCCCTAAGGTGGAGTACAAATCTCCACCATCACCGTATGTTTACAACTCTCCACCACCATCATATTATTCACCATCCCCTAAGGTAGATTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTTTATAGTTCTCCACCACCACCATATTACTCTCCATCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCTCCATCCCCTAAGGTTGTATACAAGTCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTACTCACCAACCCCGAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCACCATCACCTAAGGTAGACTACAAGTCTCCACCACCACCATACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCTCCTAAGATAGTCTACAAATCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCCCCACCACCCCCATACTACACACCTTCACCAAAGGTTGTATACAAGTCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCCCCACCACCACCATACTACTCACCATCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCTCCACCACCATACTACTCGCCATCTCCAAAGGTTGTATACAAATCTCCTCCTCCACCATATGTTTACAGTTCTCCTCCACCACCATACTATTCACCATCCCCTAAGGTAGACTACAAGTCTCCTCCACCACCATATGTTTACAGTTCTCCACCACCACCGTACTACTCTCCTTCACCAAAGGTTTTATACAAGTCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATACTACTCTCCTTCTCCTAAGGTAGTCTACAAGTCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCTCCTTCTCCTAAAGTAGTTTACAAGTCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTACGTCTACAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAAGTAGACTACAAATCTCCTCCACCACCGTACGTCTATAGCTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCGAAGGTAGACTACAAATCTCCCCCACCACCGTATGTCTACAGCTCACCCCCACCACCATACTACTCACCTGCCCCTAAGGTAGATTACAAATCTCCACCACCACCATACGTCTATAGTTCACCACCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTTGACTACAAATCTCCTCCACCACCATACTACTCACCTTCCCCTAAGGTTGACTACAAATCTCCTCCACCACCATATGTCTACAGTTCTCCACCACCACCATCATACTCACCTTCTCCAAAAACTGAGTACTAA
Protein Sequence
- >AT3G28550.2 MISSSKMGPSAHLVYAIGVIIMATMVAAYEPYTDSSPPPYSVPLPKVEYKSPPLPDVYSSPPPPLEYSPAPKVDYKSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPIYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPSPYVYNSPPPSYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPTPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKIVYKSPPPPYVYSSPPPPYYTPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVLYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPAPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPSYSPSPKTEY
- >AT3G28550.1 MISSSKMGPSAHLVYAIGVIIMATMVAAYEPYTDSSPPPYSVPLPKVEYKSPPLPDVYSSPPPPLEYSPAPKVDYKSPPPPYYSPSPKVEYKSPPPPYVYNSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPIYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVEYKSPPSPYVYNSPPPSYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPTPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKIVYKSPPPPYVYSSPPPPYYTPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVLYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVVYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPAPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYYSPSPKVDYKSPPPPYVYSSPPPPSYSPSPKTEY