Gene Details:

  • Gene ID: AT3G46610
  • Gene Symbol: LPE1
  • Gene Name: LOW PHOTOSYNTHETIC EFFICIENCY 1
  • Description: Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein;(source:Araport11)
  • TAIR Accession: locus:2075165
  • Genome: Araport11_genome_release
  • Species: Arabidopsis thaliana

Transcripts:

Gene Ontology:

  • GO:0010207  — involved in — photosystem II assembly
  • GO:0032544  — acts upstream of or within — plastid translation
  • GO:0009535  — located in — chloroplast thylakoid membrane
  • GO:0006413  — involved in — translational initiation
  • GO:0010207  — acts upstream of or within — photosystem II assembly
  • GO:0005739  — located in — mitochondrion
  • GO:0003723  — enables — RNA binding
  • GO:0009416  — involved in — response to light stimulus
  • GO:0009570  — located in — chloroplast stroma
  • GO:0043022  — enables — ribosome binding
  • GO:0003729  — enables — mRNA binding
  • GO:0008494  — enables — translation activator activity
  • GO:0005515  — enables — protein binding

Literature:

Sequence:

cDNA Sequence
  • >AT3G46610.1 CAAAAATTCTATCTTCTTCTTCGCGGCTCTGAATCCGCCATTGAAGTTATTTTCAAGCCCTCCTCAATTTTCGTTTTTGTTCAATATTAATTTGTAAGAGATCTTTACGCTTCAGTTTCTGAAAGAACTTTGCGCTTCTGATTTTGCAAAATTGGAAGAGAGTGCTTCCGTTGCGCTTTTGAAGCGTGAAATCGTGTGTCTTTTGACGCTTCCATGCTACATAACGCTAGTTGTGAGATTGTGTTTGGAAAAAGATGCAAGCTTTAAGCATTTTGCCATTAAAGTCTGGTCTTTTAGTTGGATCAAGATTGGAATTTGAGTTGGATTGTTCTTGTTTTGTAGTTAGCCCTAAGACTACTAGAAAGAGACTTTGCTTTCTTGAACAGGCTTGCTTCGGTAGTAGTAGTAGTATCTCTAGCTTCATCTTCGTTTCGAGTAACAGGAAAGTTCTGTTTTTGTGTGAGCCAAAGAGAAGTTTGTTGGGATCATCGTTTGGGGTAGGATGGGCCACTGAGCAACGAGAGCTCGAGCTCGGGGAAGAAGAAGTTTCCACGGAAGATTTAAGTTCAGCAAATGGAGGAGAAAAGAACAATTTAAGAGTTGATGTTAGAGAATTAGCGTTTAGTTTACGAGCTGCTAAGACAGCTGATGATGTGGATGCTGTTCTCAAGGACAAGGGAGAGTTGCCTCTGCAAGTCTTTTGTGCTATGATAAAGGGTTTTGGCAAGGACAAGAGATTGAAGCCTGCGGTAGCTGTAGTAGATTGGCTTAAGAGGAAGAAGAGTGAATCAGGCGGTGTCATAGGTCCAAATCTTTTTATATATAACAGCCTTTTGGGTGCTATGAGAGGGTTTGGGGAAGCAGAGAAGATACTGAAAGATATGGAGGAAGAAGGGATTGTTCCAAACATTGTTACTTACAATACTTTGATGGTTATTTACATGGAGGAAGGTGAGTTTCTCAAGGCTCTTGGGATTCTTGATTTAACCAAGGAAAAGGGTTTTGAGCCTAACCCGATTACATATTCAACGGCTTTGCTTGTTTACAGAAGAATGGAAGACGGTATGGGAGCTTTAGAGTTCTTTGTTGAATTGAGAGAGAAATACGCAAAGAGGGAAATAGGGAATGATGTTGGTTACGATTGGGAATTTGAGTTTGTTAAGCTTGAGAACTTTATTGGTAGAATATGCTACCAAGTGATGAGGCGGTGGTTGGTGAAAGATGATAATTGGACTACTAGAGTGTTGAAGCTTTTGAATGCAATGGACAGTGCAGGGGTTAGACCGAGTAGGGAAGAGCACGAGAGGCTTATATGGGCATGTACTCGTGAAGAGCATTATATTGTTGGTAAAGAGTTGTATAAAAGAATCAGAGAGAGGTTTTCTGAGATAAGTCTGTCTGTTTGCAACCATTTGATTTGGCTGATGGGTAAGGCTAAGAAATGGTGGGCAGCGTTGGAGATCTACGAGGATCTTCTTGACGAAGGACCTGAACCTAACAATTTGTCTTATGAGTTAGTGGTCTCTCATTTCAATATCTTGCTGAGTGCAGCTAGCAAGAGAGGGATATGGAGATGGGGAGTTAGGTTACTTAACAAAATGGAAGATAAAGGATTGAAACCGCAGAGGAGACATTGGAACGCGGTTCTTGTAGCATGTTCAAAAGCCTCTGAGACCACAGCTGCGATCCAAATCTTTAAAGCAATGGTTGACAATGGTGAAAAGCCAACGGTCATCTCATACGGTGCACTACTCAGTGCTCTTGAGAAAGGGAAGCTATATGATGAGGCGTTTCGGGTTTGGAACCATATGATTAAGGTAGGGATTGAGCCAAATCTTTACGCGTACACAACAATGGCTTCAGTTTTGACAGGACAGCAAAAGTTCAATCTTTTGGATACCCTTCTCAAGGAAATGGCTTCAAAGGGTATTGAACCGAGCGTTGTGACTTTCAACGCGGTTATAAGTGGTTGCGCGAGGAACGGGTTAAGTGGTGTGGCTTATGAGTGGTTTCATAGAATGAAAAGTGAGAATGTTGAGCCTAACGAGATAACTTACGAGATGTTGATTGAGGCTCTTGCAAATGATGCAAAGCCAAGGCTTGCTTATGAGTTACATGTGAAGGCTCAAAACGAAGGGCTTAAACTCTCTTCTAAGCCATATGATGCGGTTGTTAAATCAGCTGAGACTTATGGAGCCACCATTGATCTTAATCTTTTGGGTCCTCGACCAGACAAAAAGAATAGACCTTAGTCTGACGAAAACACATTGTACAAGGTTACCGTGGGGTAAGGCGCATCCAAGGACCCTTAAAGGCAAGAAAATTGCCATTACAGGGAAGAAGAAAGTTTCCAAGTTTCCAGCAAGAAACAGCATAA
  • >AT3G46610.2 CAAAAATTCTATCTTCTTCTTCGCGGCTCTGAATCCGCCATTGAAGTTATTTTCAAGCCCTCCTCAATTTTCGTTTTTGTTCAATATTAATTTGTAAGAGATCTTTACGCTTCAGTTTCTGAAAGAACTTTGCGCTTCTGATTTTGCAAAATTGGAAGAGAGTGCTTCCGTTGCGCTTTTGAAGCGTGAAATCGTGTGTCTTTTGACGCTTCCATGCTACATAACGCTAGTTGTGAGATTGTGTTTGGAAAAAGATGCAAGCTTTAAGCATTTTGCCATTAAAGTCTGGTCTTTTAGTTGGATCAAGATTGGAATTTGAGTTGGATTGTTCTTGTTTTGTAGTTAGCCCTAAGACTACTAGAAAGAGACTTTGCTTTCTTGAACAGGCTTGCTTCGGTAGTAGTAGTAGTATCTCTAGCTTCATCTTCGTTTCGAGTAACAGGAAAGTTCTGTTTTTGTGTGAGCCAAAGAGAAGTTTGTTGGGATCATCGTTTGGGGTAGGATGGGCCACTGAGCAACGAGAGCTCGAGCTCGGGGAAGAAGAAGTTTCCACGGAAGATTTAAGTTCAGCAAATGGAGGAGAAAAGAACAATTTAAGAGTTGATGTTAGAGAATTAGCGTTTAGTTTACGAGCTGCTAAGACAGCTGATGATGTGGATGCTGTTCTCAAGGACAAGGGAGAGTTGCCTCTGCAAGTCTTTTGTGCTATGATAAAGGGTTTTGGCAAGGACAAGAGATTGAAGCCTGCGGTAGCTGTAGTAGATTGGCTTAAGAGGAAGAAGAGTGAATCAGGCGGTGTCATAGGTCCAAATCTTTTTATATATAACAGCCTTTTGGGTGCTATGAGAGGGTTTGGGGAAGCAGAGAAGATACTGAAAGATATGGAGGAAGAAGGGATTGTTCCAAACATTGTTACTTACAATACTTTGATGGTTATTTACATGGAGGAAGGTGAGTTTCTCAAGGCTCTTGGGATTCTTGATTTAACCAAGGAAAAGGGTTTTGAGCCTAACCCGATTACATATTCAACGGCTTTGCTTGTTTACAGAAGAATGGAAGACGGTATGGGAGCTTTAGAGTTCTTTGTTGAATTGAGAGAGAAATACGCAAAGAGGGAAATAGGGAATGATGTTGGTTACGATTGGGAATTTGAGTTTGTTAAGCTTGAGAACTTTATTGGTAGAATATGCTACCAAGTGATGAGGCGGTGGTTGGTGAAAGATGATAATTGGACTACTAGAGTGTTGAAGCTTTTGAATGCAATGGACAGTGCAGGGGTTAGACCGAGTAGGGAAGAGCACGAGAGGCTTATATGGGCATGTACTCGTGAAGAGCATTATATTGTTGGTAAAGAGTTGTATAAAAGAATCAGAGAGAGGTTTTCTGAGATAAGTCTGTCTGTTTGCAACCATTTGATTTGGCTGATGGGTAAGGCTAAGAAATGGTGGGCAGCGTTGGAGATCTACGAGGATCTTCTTGACGAAGGACCTGAACCTAACAATTTGTCTTATGAGTTAGTGGTCTCTCATTTCAATATCTTGCTGAGTGCAGCTAGCAAGAGAGGGATATGGAGATGGGGAGTTAGGTTACTTAACAAAATGGAAGATAAAGGATTGAAACCGCAGAGGAGACATTGGAACGCGGTTCTTGTAGCATGTTCAAAAGCCTCTGAGACCACAGCTGCGATCCAAATCTTTAAAGCAATGGTTGACAATGGTGAAAAGCCAACGGTCATCTCATACGGTGCACTACTCAGTGCTCTTGAGAAAGGGAAGCTATATGATGAGGCGTTTCGGGTTTGGAACCATATGATTAAGGTAGGGATTGAGCCAAATCTTTACGCGTACACAACAATGGCTTCAGTTTTGACAGGACAGCAAAAGTTCAATCTTTTGGATACCCTTCTCAAGGAAATGGCTTCAAAGGGTATTGAACCGAGCGTTGTGACTTTCAACGCGGTTATAAGTGGTTGCGCGAGGAACGGGTTAAGTGGTGTGGCTTATGAGTGGTTTCATAGAATGAAAAGTGAGAATGTTGAGCCTAACGAGATAACTTACGAGATGTTGATTGAGGCTCTTGCAAATGATGCAAAGCCAAGGCTTGCTTATGAGTTACATGTGAAGGCTCAAAACGAAGGGCTTAAACTCTCTTCTAAGCCATATGATGCGGTTGTTAAATCAGCTGAGACTTATGGAGCCACCATTGATCTTAATCTTTTGGGTCCTCGACCAGACAAAAAGAATAGACCTTAGTCTGACGAAAACACATTGTACAAGGTTACCGTGGGGTAAGGCGCATCCAAGGACCCTTAAAGGCAAGAAAATTGCCATTACAGGGAAGAAGAAAGTTTCCAAGTTTCCAGCAAGAAACAGCATAA
CDS Sequence
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Protein Sequence
  • >AT3G46610.1 MQALSILPLKSGLLVGSRLEFELDCSCFVVSPKTTRKRLCFLEQACFGSSSSISSFIFVSSNRKVLFLCEPKRSLLGSSFGVGWATEQRELELGEEEVSTEDLSSANGGEKNNLRVDVRELAFSLRAAKTADDVDAVLKDKGELPLQVFCAMIKGFGKDKRLKPAVAVVDWLKRKKSESGGVIGPNLFIYNSLLGAMRGFGEAEKILKDMEEEGIVPNIVTYNTLMVIYMEEGEFLKALGILDLTKEKGFEPNPITYSTALLVYRRMEDGMGALEFFVELREKYAKREIGNDVGYDWEFEFVKLENFIGRICYQVMRRWLVKDDNWTTRVLKLLNAMDSAGVRPSREEHERLIWACTREEHYIVGKELYKRIRERFSEISLSVCNHLIWLMGKAKKWWAALEIYEDLLDEGPEPNNLSYELVVSHFNILLSAASKRGIWRWGVRLLNKMEDKGLKPQRRHWNAVLVACSKASETTAAIQIFKAMVDNGEKPTVISYGALLSALEKGKLYDEAFRVWNHMIKVGIEPNLYAYTTMASVLTGQQKFNLLDTLLKEMASKGIEPSVVTFNAVISGCARNGLSGVAYEWFHRMKSENVEPNEITYEMLIEALANDAKPRLAYELHVKAQNEGLKLSSKPYDAVVKSAETYGATIDLNLLGPRPDKKNRP
  • >AT3G46610.2 MQALSILPLKSGLLVGSRLEFELDCSCFVVSPKTTRKRLCFLEQACFGSSSSISSFIFVSSNRKVLFLCEPKRSLLGSSFGVGWATEQRELELGEEEVSTEDLSSANGGEKNNLRVDVRELAFSLRAAKTADDVDAVLKDKGELPLQVFCAMIKGFGKDKRLKPAVAVVDWLKRKKSESGGVIGPNLFIYNSLLGAMRGFGEAEKILKDMEEEGIVPNIVTYNTLMVIYMEEGEFLKALGILDLTKEKGFEPNPITYSTALLVYRRMEDGMGALEFFVELREKYAKREIGNDVGYDWEFEFVKLENFIGRICYQVMRRWLVKDDNWTTRVLKLLNAMDSAGVRPSREEHERLIWACTREEHYIVGKELYKRIRERFSEISLSVCNHLIWLMGKAKKWWAALEIYEDLLDEGPEPNNLSYELVVSHFNILLSAASKRGIWRWGVRLLNKMEDKGLKPQRRHWNAVLVACSKASETTAAIQIFKAMVDNGEKPTVISYGALLSALEKGKLYDEAFRVWNHMIKVGIEPNLYAYTTMASVLTGQQKFNLLDTLLKEMASKGIEPSVVTFNAVISGCARNGLSGVAYEWFHRMKSENVEPNEITYEMLIEALANDAKPRLAYELHVKAQNEGLKLSSKPYDAVVKSAETYGATIDLNLLGPRPDKKNRP