Gene Details:
- Gene ID: AT4G31480
- Gene Symbol: beta1-COP
- Gene Name: beta1 Coat Protein
- Description: Coatomer, beta subunit;(source:Araport11)
- TAIR Accession:
- Genome: Araport11_genome_release
- Species: Arabidopsis thaliana
Transcripts:
- AT4G31480.1 AT4G31480.2 AT4G31480.9 AT4G31480.3 AT4G31480.7 AT4G31480.6 AT4G31480.8 AT4G31480.5 AT4G31480.4
Plant Ontology Annotations:
- PO:0000293 — guard cell — célula guardiana (Spanish, exact), occlusive cell (exact), 孔辺細胞 (Japanese, exact)
Germplasm Phenotype:
- SALK_002734 — Hyper sensitive to salt stress.
Function-related keywords:
Literature:
- A genomic analysis of the shade avoidance response in Arabidopsis. DOI: 10.1104/pp.103.034397 ; PMID: 14645734
- A chloroplast-localized vesicular transport system: a bio-informatics approach. DOI: 10.1186/1471-2164-5-40 ; PMID: 15236667
- Temporal analysis of sucrose-induced phosphorylation changes in plasma membrane proteins of Arabidopsis. DOI: 10.1074/mcp.M700164-MCP200 ; PMID: 17586839
- Loss of Arabidopsis β-COP Function Affects Golgi Structure, Plant Growth and Tolerance to Salt Stress. DOI: 10.3389/fpls.2020.00430 ; PMID: 32351533
- SINAT E3 Ubiquitin Ligases Mediate FREE1 and VPS23A Degradation to Modulate Abscisic Acid Signaling. DOI: 10.1105/tpc.20.00267 ; PMID: 32753431
- ADP-ribosylation factor D1 modulates Golgi morphology, cell plate formation, and plant growth in Arabidopsis. DOI: 10.1093/plphys/kiac329 ; PMID: 35876822
Sequence:
cDNA Sequence
- >AT4G31480.4 ACCCAAAAGGATTTGGAGGAGTTAATTCACCTGACGAATCCACCACCATAATATTAAGCACATTTGATCTCTCACTTCCTTGGTGCGAGTGTTTTGTTTTCCGAGATCCAAAATCTTCTCTTGGATCCAAAGCTGTGTTACTGTGGATCTCCTCCTCCTCTCTCCCTGGATCTCGTACCTTTGAGGTTTGTCTCTCTGTGTTAAACTTGCGACTCAGATTTCATAGAGATCGATCCCACTTTTGCCTTTTCCTTTGTGAAAATCTACAATGTTCAATTATTCTCTGGCGCTCTTTGTTTGATCTCGTTGAATATTGATCTGATTCCGGTAGGAAACCGATTTTCATGTTTGTGCAGCTGAGTGAGACTGCGAATTATGTAGATTTCATTGTTTGTTCATCTAATCTGGGGAGATAGATCGCATTTTTTTTTTTTTTGAATTTTGGTTGATCCGAAGCTGTTTTAACTGATTTTTCGTTTTTATGTTATTATTTTGGTCGTAGTTGTAGTACAGTGATGTGTATTGCTGGATCTGAGGATTTAGATTTGTCAATGTTTTGCATCTTTGGGTCTCTGATTGGACATTACCGAATATTCTTCTGAAATTATGATGTTTTCTCATAAACCACGGATTCGAGAATAGAGATCATGTATTCAATGTATTGAAATCCAAGCAGAGAGGTATGGATTATCGCCGATGATACTGTTGAACTTCTTGTATAGAACTTACTCTAGCACTGATGAGGACACTAGTAAGCACCGGAGAAGATGGACAAATCTAGTACCATGCTTGTTCACTATGACAAAGGGACTCCAGCAGTTGCTAATGAGATTAAAGAAGCTCTCGAAGGAAATGATGTTGAAGCTAAAGTTGATGCCATGAAGAAGGCAATTATGCTTTTGCTGAATGGTGAAACCATTCCTCAGCTTTTCATAACCATTATAAGATATGTGCTACCTTCTGAGGACCACACAATCCAAAAGCTTCTGTTGCTGTACCTGGAGCTGATTGAAAAGACTGATTCTAAGGGGAAGGTGTTACCTGAAATGATTTTGATATGCCAGAATCTTCGTAATAACCTTCAGCATCCTAATGAGTACATCCGTGGAGTGACACTGAGGTTTCTCTGCCGGATGAAGGAGACTGAAATTGTGGAGCCTTTAACTCCATCAGTGTTACAAAATCTGGAGCATCGCCATCCATTTGTTCGCAGGAATGCCATTCTGGCCATCATGTCGATATATAAGCTTCCACAAGGCGACCAACTCTTTGTGGATGCGCCTGAAATGATCGAGAAAGTTCTATCAACCGAACAAGATCCTTCTGCCAAGAGAAATGCATTTCTAATGCTCTTTACCTGTGCTGAAGAACGTGCAGTGAATTATCTTCTGAGCAATGTTGACAAGGTTTCAGACTGGAATGAATCACTTCAGATGGTGGTGCTGGAGTTGATTCGAAGTGTGTGTAAGACTAAACCAGCAGAGAAGGGGAAATATATTAAGATTATTATTTCTCTGTTAAGTGCTACTTCTTCTGCAGTTATCTATGAATGTGCTGGGACACTTGTTTCTCTCTCATCTGCCCCTACTGCGATTCGGGCTGCTGCCAACACCTACTGCCAACTTCTTCTTTCTCAGAGTGACAACAATGTGAAGCTTATTTTACTCGATCGGTTGTATGAGCTTAAGACATTGCACAGAGATATCATGGTTGAGTTGATAATAGATGTGCTCAGAGCACTCTCAAGCCCAAACCTTGATATCCGCAGGAAGACGCTTGACATTTCCCTTGACTTGATTACCCATCATAATATCAATGAGGTCGTTCAAATGTTGAAGAAAGAAGTTGTGAAGACACAGAGTGGAGAACTTGAGAAGAATGGGGAGTACAGACAAATGCTTATTCAAGCCATCCACGCTTGTGCAGTGAAGTTCCCCGAAGTTGCAAGCACAGTGGTCCACCTTCTGATGGACTTCTTGGGAGATAGCAATGTGGCTTCAGCTCTTGACGTGGTTGTTTTTGTTAGAGAGATAATAGAAACAAATCCCAAGTTAAGAGTTTCAATCATCACAAGGTTATTGGACACGTTCTATCAGATCCGAGCAGGAAAGGTCTGCCCTTGTGCCCTTTGGATAATTGGGGAGTATTGCCTATCACTTTCGGAAGTTGAGAGTGGCATTTCAACTATCACGCAATGCCTTGGCGAATTACCATTTTACTCTGTTTCTGAGGAGTCTGAGCCAACTGAGACATCAAAGAAGATTCAGCCTACCTCTTCTGCCATGGTGTCCTCTAGAAAGCCAGTGATTCTTGCTGATGGAACTTATGCTACCCAAAGCGCAGCCTCTGAAACCACATTCTCCTCACCTACAGTTGTTCAAGGATCACTGACTTCTGGAAATTTGAGAGCACTGCTACTAACTGGTGATTTTTTCCTCGGAGCAGTGGTTGCTTGCACGTTGACCAAACTTGTTCTTAGGTTAGAAGAGGTTCAGTCTTCTAAAACTGAAGTAAATAAGACAGTCACACAGGCTTTGTTGATCATGGTTTCTATGTTGCAACTTGGGCAATCTCCTGTTTCTCCACACCCTATTGATAATGATTCGTATGAGAGGATTGTGTTGTGCATAAAATTGCTTTGCCATAGGAATGATGAGATGAAAAAGATATGGTTAGAATCCTGCCGCCAGAGTTTTGTCAAGATGATTTCTGAAAAACAGCTTAGAGAGATGGAGGAACTGAAGGCGAAGACCCAAACAACGCATGCTCAACCTGATGATCTAATTGACTTCTTCCATCTAAAGAGTCGGAAGGGAATGAGTCAACTTGAGTTGGAAGACCAAGTACAAGATGACCTAAAGCGTGCAACTGGAGAATTCACCAAGGACGAGAACGATGCTAACAAACTTAACCGCATTCTTCAACTCACAGGATTCAGTGACCCAGTCTATGCTGAAGCATATGTGACGGTACACCATTATGATATTGCTCTTGAAGTTACAGTAATCAACCGAACCAAGGAAACCCTTCAGAACTTGTGCTTGGAGTTAGCAACCATGGGTGATCTCAAACTTGTTGAGCGTCCTCAGAACTACAGTCTGGCACCTGAAAGAAGCATGCAGATTAAAGCAAACATCAAGGTGTCGTCCACAGAGACGGGAGTCATATTCGGGAACATCGTCTATGAGACATCAAATGTAATGGAGCGAAACGTCGTTGTTCTTAATGACATACACATTGATATCATGGACTATATCTCCCCTGCTGTGTGTTCAGAGGTTGCTTTCAGAACTATGTGGGCAGAGTTCGAATGGGAAAACAAGGTTGCTGTGAACACCACAATACAAAACGAAAGAGAATTCCTCGACCACATTATCAAATCTACAAACATGAAATGTCTCACTGCTCCATCCGCAATAGAAGGCGAATGTGGATTCCTTGCAGCAAACTTATACGCAAAAAGTGTATTTGGTGAGGATGCTCTTGTGAATGTGAGTATTGAGAAGCAAACGGATGGAGCATTGAGTGGTTACATAAGGATAAGGAGCAAGACGCAAGGGATTGCCCTAAGTCTTGGGGACAAAATCACCCTCAAACAAAAGGGTAGTAGCTGAGTACCATACCGATGATTTCTCACAGTGGCGTGCAAAGGTAACAGGTTTAGACTACGTACGTTTCTCTTGAGCAATTATCGTTGGTTGAATCTGCTTATTATATGGAGGGAGGAGGCGTTCAAGGGTATATGTAAAAAGAGTAATTGGCTATCGTTCTTACTTAACCGGTATATTTTCTGGTATGGTACCGATGGATTTCTTCATCTCATATGGCAGTGTGTTTTTTACTGTACTAGACGATTTTGTTTTATTTGTAATGCTTTTTCTTCTATAATGTCGTTTGTTGAGGACTTTAAACCGTGAACTTTATGATATTGTAGATTTCAAAGCTACATTTGGTTTGCTCCATTTTAGAACTCGTCATTTCAGATTTGATCTCTATTCTTTTCTTTCATATGCATTTGAAGTGAACTATTCAATTGTC
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CDS Sequence
Protein Sequence