Gene Details:

  • Gene ID: AT5G12440
  • Gene Symbol: AtC3H55
  • Gene Name:
  • Description: CCCH-type zinc fingerfamily protein with RNA-binding domain-containing protein;(source:Araport11)
  • TAIR Accession: locus:505006612
  • Genome: Araport11_genome_release
  • Species: Arabidopsis thaliana

Transcripts:

Plant Ontology Annotations:

  • PO:0009005  — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)

Gene Ontology:

  • GO:1903046  — acts upstream of or within — meiotic cell cycle process
  • GO:0016070  — acts upstream of or within — RNA metabolic process
  • GO:0005634  — located in — nucleus
  • GO:0010228  — acts upstream of or within — vegetative to reproductive phase transition of meristem
  • GO:0040007  — acts upstream of or within — growth
  • GO:0009888  — acts upstream of or within — tissue development
  • GO:0019538  — acts upstream of or within — protein metabolic process
  • GO:0048532  — acts upstream of or within — anatomical structure arrangement
  • GO:0010605  — acts upstream of or within — negative regulation of macromolecule metabolic process
  • GO:0010468  — acts upstream of or within — regulation of gene expression

Literature:

Sequence:

cDNA Sequence
  • >AT5G12440.2 CCGATTTGGGTAAATGATGATGGTTTAGGTATTTTGATATTGCTGGCTCTGGTTCGCCGCTCTGGTTCGCCGGTTTGGTCTCTTCTTCTTCAACCGTCTTCTTGTTTGGTTTGCGATCTTCGGTGTCTGTCTGTGCTCTGCTCTCTTTCAGGGGAATCGATCACTATAATATTATCTCTGTTACCGGACATAAGGAGTTACATGATGCTACTTGGACAACAGAGAATGCTTTGAATGAAACACTGAGAACTTCGGGGGTCTTGAGAATGAAGTTTTGGGGAGGCTTATTAGTGATCGTTGGTTGCGTTTCATTTGTTGGATTTGTGTTTGTAGCTATAGTGTCTAAATTGTTTCCACTCTCTGACAATCCCATTATCCAAGCTATTCAGAATGACAGGTACACTCTTGTTCCATGCTAATGTTTGTTTGCATATATCATTCTTGTTATATTGATATCCATCATGTTGATATCTGTTACGTGTATGTCATCTCATGATTTATATTTCATATAAAAACATTCTTCAGGTACTACTGCTTCTTGGCTCCACTGACTCTACCAGCTCTTCTGGTTGCTGTTTACTTTCATTGGCTTAGCATGAAGCTCTTCAAGCACGCATGATATATCACTGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTATCAACTGGGGAAGAAGAAAGGTGTAACCTTTATATAACCATGGATTCCGGTGACGCGACATCTTTGCTTTTGACGAAAATTCGAAGCTTGGAGCCAGATTATGCTCCTAAGATTATTGGGTATTTGCTTTTACATGATTTTGGTGATAGAGACTTGATGCATCTGGCTCGTGGACCTGAATCGATTTTGCAGTCGACTATTTCGAAAGTGAAGAGTCTCTTGGGGATTTTCTCCAACAACTCGCCTTCTTCTACTCCGACGTCTCCTTCTCCGTTGAATCCTATCTGTCGTCCTCCTCTTAACGGAAGAGGAAGCTCTCACTCCAATGGGTTTATGGATTTCCGTAGAAACTCTCCGTCTTCTCCTTCTTCTACCTCTCCTTGGTCATTCAACAACTGTATCAACGGTAATAATGGGAATAACCCCCACATTTCCCCTAAACACACTCCGATCTCGAAACCCTTTAGCTCTCACCAAAGCAATGGACTTTCTGCTACACATTCTGGTAGTGCTGACGCTGCTGGTGGTGCTGATTTACTTGATGATCAGCAGCTTAATGATTGCCTTTCGTTTCTCGACGATTCTTGTTCTAAAACCGAGGATCTTGTGGATCCTAGCATTCCTTTGGATTACTCTGTAGATGGTGATGGTGAAACCCATCTGCACAGGAGGAGTTTCTCTTGTGATGCGTCTTTTGTGTCCGGAGATGATGGATTTGGTGGTGGATGCAAACCATGTGTGTATTTTAGTAGAGGTTTGTGCAAGAATGGAGAAAGCTGCAAGTTTATCCACGGTGGATATCCGGATAATATGGATGGTAATGGCATTGTCGCTGACTCGCCTAGGAAAATGGAGAACTTTGTTAGGCAGCACGAGGAGATGATGAGGCTGAAATTGGCTTACCAGCAGCAGAGGTTGGCTTCTCAAATCCTGGGTCGGGCTCCCCAGTTGCCATACGAGAAAAGAATGGACTTTCTCTTGCAGCAGCATGCTCAAAGAGATGGTGGACTGCCTTTTGGTGATGAAAGATTTTGGAGCAGCAGCCCAGGACGGCTTGAGAGGATGGAGCTGGCAATGCATTTAGGTGATCAGTCAAATTCGGCATCTAGACAGATTTACTTGACATTCCCAGCTGACAGCACGTTTAAGGATGAGGATGTTGCTACATATTTCAGCCTCTTTGGAACAGTCCAAGATGTGCGGATCCCATACCAACAGAAGCGTATGTTTGGCTTTGTTTCATTTGCTCATCCCGAGACAGTGAAAGTTGTACTAGCTAGAGGGAATCCCCATTTCATTTGCGACTCACGGGTTCTTGTCAAACCTTACAAAGAAAAAGGCAAAGTCTTGGACAAGAAGCAACAGCAACTGCTACAACAGCAGATTGAGCGAGGAAATTACTCCCCGTGCTCCAGTCCATCTGGGATTGATCCTAGAGAACAGTCTGATTTCCACCTTGGTTCAAAGATGTTGTATGAGAGACGTGAGATGATGAGAAGGAAAATAGAGCAGGCTGATCTCCTGAGGGCTATTGAACTCGAAAGAAGACGTTTCATTAATTTACAGCTTCCTGAGTTCAAGAATAGTGTAACGCTGAATCATCACCGTAGCTTTTCTGTGGGGTCTCCTGGTTATTTTTCATCTGCCGGCAATCAAAGCCCTGATTTTCAATCTGAACTTAACGGTGCAGATGCTTTAAAAGTAACTGATGATACCTTGGAGCTGCATCCTTACCCAGTAGTCAACCCAATGAGTGTTAACAATAGCTACTCAAACGGTGCAAAAGAAGAGACTAACAAGAGTGAATTGCTTGATCCCGATTCTGGAAGCACCATTGAGCTTGTTCTTCCTAGTAACCTCTTCCCTTCTGCATCATCTACCGATGATCACAAAACCGATGATTCTGCTGAAACTAATGCAAAAGTTGGAGTCTCCTCTACTAATGAAAATGACCATGAACCACCAGTCACTACCAATAATCTGATGCAGTAGGCTATTTCACCTCATAAATGCCAAGGGTTTTTTCTTATGGATAAGATGAGGCTACCGAAGTGTATGTAATAAAGACAAAGTAAACAAGCATACACAAGGAAGTAGGATGATGTATATGTATAGCTAAGTTATATATATCTATATATATATGGAGAACAGAAAGAACGTAGGAGATATGATAATATGGTATGAAGATCGCAAGTTTCCTCAGGTGATACTATACTACTAACAAACGGATGCGTAAGACATACTTTAAAGACGATCTATTTTGGAACTTTCATTTCTTCTGCTTCTATCTGTTTGCTTCTAATATCGGTTGCTCATGTGATTGTTCCGGTTTATGTGGGTAACAAACCACAAGAGTCTCTGATGTAACAAAAGAATAGAGGGTTCTGTAACTT
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  • >AT5G12440.11 CCGATTTGGGTAAATGATGATGGTTTAGGTATTTTGATATTGCTGGCTCTGGTTCGCCGCTCTGGTTCGCCGGTTTGGTCTCTTCTTCTTCAACCGTCTTCTTGTTTGGTTTGCGATCTTCGGTGTCTGTCTGTGCTCTGCTCTCTTTCAGGGGAATCGATCACTATAATATTATCTCTGTTACCGGACATAAGGAGTTACATGATGCTACTTGGACAACAGAGAATGCTTTGAATGAAACACTGAGAACTTCGGGGGTCTTGAGAATGAAGTTTTGGGGAGGCTTATTAGTGATCGTTGGTTGCGTTTCATTTGTTGGATTTGTGTTTGTAGCTATAGTGTCTAAATTGTTTCCACTCTCTGACAATCCCATTATCCAAGCTATTCAGAATGACAGGTACACTCTTGTTCCATGCTAATGTTTGTTTGCATATATCATTCTTGTTATATTGATATCCATCATGTTGATATCTGTTACGTGTATGTCATCTCATGATTTATATTTCATATAAAAACATTCTTCAGGTACTACTGCTTCTTGGCTCCACTGACTCTACCAGCTCTTCTGGTTGCTGTTTACTTTCATTGGCTTAGCATGAAGCTCTTCAAGCACGCATGATATATCACTGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTATCAACTGGGGAAGAAGAAAGGTGTAACCTTTATATAACCATGGATTCCGGTGACGCGACATCTTTGCTTTTGACGAAAATTCGAAGCTTGGAGCCAGATTATGCTCCTAAGATTATTGGGTATTTGCTTTTACATGATTTTGGTGATAGAGACTTGATGCATCTGGCTCGTGGACCTGAATCGATTTTGCAGTCGACTATTTCGAAAGTGAAGAGTCTCTTGGGGATTTTCTCCAACAACTCGCCTTCTTCTACTCCGACGTCTCCTTCTCCGTTGAATCCTATCTGTCGTCCTCCTCTTAACGGAAGAGGAAGCTCTCACTCCAATGGGTTTATGGATTTCCGTAGAAACTCTCCGTCTTCTCCTTCTTCTACCTCTCCTTGGTCATTCAACAACTGTATCAACGGTAATAATGGGAATAACCCCCACATTTCCCCTAAACACACTCCGATCTCGAAACCCTTTAGCTCTCACCAAAGCAATGGACTTTCTGCTACACATTCTGGTAGTGCTGACGCTGCTGGTGGTGCTGATTTACTTGATGATCAGCAGCTTAATGATTGCCTTTCGTTTCTCGACGATTCTTGTTCTAAAACCGAGGATCTTGTGGATCCTAGCATTCCTTTGGATTACTCTGTAGATGGTGATGGTGAAACCCATCTGCACAGGAGGAGTTTCTCTTGTGATGCGTCTTTTGTGTCCGGAGATGATGGATTTGGTGGTGGATGCAAACCATGTGTGTATTTTAGTAGAGGTTTGTGCAAGAATGGAGAAAGCTGCAAGTTTATCCACGGTGGATATCCGGATAATATGGATGGTAATGGCATTGTCGCTGACTCGCCTAGGAAAATGGAGAACTTTGTTAGGCAGCACGAGGAGATGATGAGGCTGAAATTGGCTTACCAGCAGCAGAGGTTGGCTTCTCAAATCCTGGGTCGGGCTCCCCAGTTGCCATACGAGAAAAGAATGGACTTTCTCTTGCAGCAGCATGCTCAAAGAGATGGTGGACTGCCTTTTGGTGATGAAAGATTTTGGAGCAGCAGCCCAGGACGGCTTGAGAGGATGGAGCTGGCAATGCATTTAGGTGATCAGTCAAATTCGGCATCTAGACAGATTTACTTGACATTCCCAGCTGACAGCACGTTTAAGGATGAGGATGTTGCTACATATTTCAGCCTCTTTGGAACAGTCCAAGATGTGCGGATCCCATACCAACAGAAGCGTATGTTTGGCTTTGTTTCATTTGCTCATCCCGAGACAGTGAAAGTTGTACTAGCTAGAGGGAATCCCCATTTCATTTGCGACTCACGGGTTCTTGTCAAACCTTACAAAGAAAAAGGCAAAGTCTTGGACAAGAAGCAACAGCAACTGCTACAACAGCAGATTGAGCGAGGAAATTACTCCCCGTGCTCCAGTCCATCTGGGATTGATCCTAGAGAACAGTCTGATTTCCACCTTGGTTCAAAGATGTTGTATGAGAGACGTGAGATGATGAGAAGGAAAATAGAGCAGGCTGATCTCCTGAGGGCTATTGAACTCGAAAGAAGACGTTTCATTAATTTACAGCTTCCTGAGTTCAAGAATAGTGTAACGCTGAATCATCACCGTAGCTTTTCTGTGGGGTCTCCTGGTTATTTTTCATCTGCCGGCAATCAAAGCCCTGATTTTCAATCTGAACTTAACGGTGCAGATGCTTTAAAAGTAACTGATGATACCTTGGAGCTGCATCCTTACCCAGTAGTCAACCCAATGAGTGTTAACAATAGCTACTCAAACGGTGCAAAAGAAGAGACTAACAAGAGTGAATTGCTTGATCCCGATTCTGGAAGCACCATTGAGCTTGTTCTTCCTAGTAACCTCTTCCCTTCTGCATCATCTACCGATGATCACAAAACCGATGATTCTGCTGAAACTAATGCAAAAGTTGGAGTCTCCTCTACTAATGAAAATGACCATGAACCACCAGTCACTACCAATAATCTGATGCAGTAGGCTATTTCACCTCATAAATGCCAAGGGTTTTTTCTTATGGATAAGATGAGGCTACCGAAGTGTATGTAATAAAGACAAAGTAAACAAGCATACACAAGGAAGTAGGATGATGTATATGTATAGCTAAGTTATATATATCTATATATATATGGAGAACAGAAAGAACGTAGGAGATATGATAATATGGTATGAAGATCGCAAGTTTCCTCAGGTGATACTATACTACTAACAAACGGATGCGTAAGACATACTTTAAAGACGATCTATTTTGGAACTTTCATTTCTTCTGCTTCTATCTGTTTGCTTCTAATATCGGTTGCTCATGTGATTGTTCCGGTTTATGTGGGTAACAAACCACAAGAGTCTCTGATGTAACAAAAGAATAGAGGGTTCTGTAACTT
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CDS Sequence
Protein Sequence