Gene Details:

  • Gene ID: AT5G16530
  • Gene Symbol: PIN5
  • Gene Name: PIN-FORMED 5
  • Description: Auxin efflux carrier family protein;(source:Araport11)
  • TAIR Accession:
  • Genome: Araport11_genome_release
  • Species: Arabidopsis thaliana

Transcripts:

Plant Ontology Annotations:

  • PO:0009005  — root — raíz (Spanish, exact), radices (exact, plural), radix (exact), 根 (Japanese, exact), aerial root (narrow), climbing root (narrow)

Germplasm Phenotype:

  • pin5-5  — Defective in lateral root initiation as well as in root and hypocotyl growth; root growth less sensitive to low concentrations of IAA.

Literature:

Sequence:

cDNA Sequence
  • >AT5G16530.2 AAAATTTATCTATAAATATGAACATGTTGGTTTCTCTATCGTAACACATTTACTATCTACGAACGAATTTAGAAGCTTTGTTTTCTTTCCTTTCGTTTGCTACTACTGCAACATTTCTATTTTTCTGATAAAACCATGATAAATTGTGGAGATGTTTACAAGGTAATCGAAGCAATGGTTCCACTCTATGTAGCCTTAATCTTAGGCTATGGCTCTGTGAAATGGTGGCACATCTTCACGCGTGATCAATGTGATGCTATAAACCGTCTCGTTTGCTATTTCACCCTGCCGCTCTTCACCATTGAGTTCACGGCCCATGTCGACCCGTTCAACATGAATTACCGGTTCATCGCGGCCGATGTCCTCTCTAAGGTCATCATAGTCACGGTCTTAGCGTTGTGGGCCAAATATAGCAACAAAGGAAGCTATTGTTGGTCCATTACTAGTTTCTCTCTATGCACTCTTACTAACTCTCTTGTCGTTGGTGTGCCATTGGCTAAGGCAATGTACGGACAACAGGCTGTTGATCTGGTGGTTCAATCCTCGGTATTTCAAGCCATCGTGTGGCTCACACTCTTGTTGTTTGTCTTAGAGTTTAGAAAAGCCGGATTTAGTAGTAATAATATCAGCGACGTACAAGTAGACAACATCAATATCGAAAGTGGAAAAAGAGAAACTGTGGTTGTGGGAGAGAAGTCGTTCCTTGAGGTCATGTCCCTCGTTTGGTTGAAGCTTGCAACGAATCCAAATTGCTATTCTTGCATCCTTGGGATCGCATGGGCTTTTATTTCTAACAGATGGCATCTGGAGCTGCCGGGCATATTAGAGGGTTCGATTCTTATAATGTCAAAAGCAGGAACAGGAACGGCCATGTTCAATATGGGAATATTCATGGCACTTCAAGAAAAGTTGATAGTATGTGGAACAAGCTTGACTGTGATGGGAATGGTATTGAAGTTTATTGCCGGACCGGCGGCCATGGCCATCGGCTCTATTGTCCTTGGCCTCCACGGTGATGTCCTCCGCGTAGCCATCATTCAGGCTGCTTTGCCACAATCGATTACTTCGTTCATTTTTGCTAAGGAATATGGATTACATGCAGATGTTCTAAGCACAGCGTAAGTCCAAATTTTAAAAATTCAGTCTATTTAAGAAGAAAATGGTAATATGAAATTAAATTAAAATTTTGATAAATGTAGGGTGATATTTGGGATGTTGGTCTCTCTACCTGTGCTCGTCGCCTACTACGCAGCTCTGGAGTTTATTCATTGATTAAACTAATAAATTCGATTATATCATCAATATTACCCTTTGTTCATCTTTCACAAGTTTTTTTTTTTGTTATCTCTTTTACACTTTCCTCCTAAAGGAGATTTTGAAGTATATTCGAGATATGAAAACCATTAACTGAATGAATTAACCTAGTTTATGCTTAATTTTATA
  • >AT5G16530.1 AAAATTTATCTATAAATATGAACATGTTGGTTTCTCTATCGTAACACATTTACTATCTACGAACGAATTTAGAAGCTTTGTTTTCTTTCCTTTCGTTTGCTACTACTGCAACATTTCTATTTTTCTGATAAAACCATGATAAATTGTGGAGATGTTTACAAGGTAATCGAAGCAATGGTTCCACTCTATGTAGCCTTAATCTTAGGCTATGGCTCTGTGAAATGGTGGCACATCTTCACGCGTGATCAATGTGATGCTATAAACCGTCTCGTTTGCTATTTCACCCTGCCGCTCTTCACCATTGAGTTCACGGCCCATGTCGACCCGTTCAACATGAATTACCGGTTCATCGCGGCCGATGTCCTCTCTAAGGTCATCATAGTCACGGTCTTAGCGTTGTGGGCCAAATATAGCAACAAAGGAAGCTATTGTTGGTCCATTACTAGTTTCTCTCTATGCACTCTTACTAACTCTCTTGTCGTTGGTGTGCCATTGGCTAAGGCAATGTACGGACAACAGGCTGTTGATCTGGTGGTTCAATCCTCGGTATTTCAAGCCATCGTGTGGCTCACACTCTTGTTGTTTGTCTTAGAGTTTAGAAAAGCCGGATTTAGTAGTAATAATATCAGCGACGTACAAGTAGACAACATCAATATCGAAAGTGGAAAAAGAGAAACTGTGGTTGTGGGAGAGAAGTCGTTCCTTGAGGTCATGTCCCTCGTTTGGTTGAAGCTTGCAACGAATCCAAATTGCTATTCTTGCATCCTTGGGATCGCATGGGCTTTTATTTCTAACAGATGGCATCTGGAGCTGCCGGGCATATTAGAGGGTTCGATTCTTATAATGTCAAAAGCAGGAACAGGAACGGCCATGTTCAATATGGGAATATTCATGGCACTTCAAGAAAAGTTGATAGTATGTGGAACAAGCTTGACTGTGATGGGAATGGTATTGAAGTTTATTGCCGGACCGGCGGCCATGGCCATCGGCTCTATTGTCCTTGGCCTCCACGGTGATGTCCTCCGCGTAGCCATCATTCAGGCTGCTTTGCCACAATCGATTACTTCGTTCATTTTTGCTAAGGAATATGGATTACATGCAGATGTTCTAAGCACAGCGTAAGTCCAAATTTTAAAAATTCAGTCTATTTAAGAAGAAAATGGTAATATGAAATTAAATTAAAATTTTGATAAATGTAGGGTGATATTTGGGATGTTGGTCTCTCTACCTGTGCTCGTCGCCTACTACGCAGCTCTGGAGTTTATTCATTGATTAAACTAATAAATTCGATTATATCATCAATATTACCCTTTGTTCATCTTTCACAAGTTTTTTTTTTTGTTATCTCTTTTACACTTTCCTCCTAAAGGAGATTTTGAAGTATATTCGAGATATGAAAACCATTAACTGAATGAATTAACCTAGTTTATGCTTAATTTTATA
CDS Sequence
Protein Sequence