Gene Details:
- MSU gene ID: LOC_Os02g05330
- RAPdb gene ID: Os02g0146600
- Gene Symbol: OseIF4A
- Genome: MSU7 , IRGSP-1.0
- Species: Oryza sativa
Functional Descriptions:
Function-related keywords:
Literature:
- De novo methyltransferase, OsDRM2, interacts with the ATP-dependent RNA helicase, OseIF4A, in rice . DOI: 10.1016/j.jmb.2013.05.021 ; PMID: 23732981
Related News:
Gene Resources:
Sequences:
cDNA Sequence
- >LOC_Os02g05330.1 cDNA GTCGGGTCCCCTTTATAACCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCCTCCCAAACCCTCAATCGTCGCATCGCCTCCTCCTCCTCTCGCCGCTCGCAGCGAAAAAGCCAGCGCCTCCCAGCGCCCACGCGATCCCGACGAATCGAATCGAGTCCGAGACGCCGATCTCGGATTCGAGACCGTTGATTTCAACCAACACAAGCCCTCCTCCGGATCGATCCGCTCCTCTTCAGCCATGGCAGGAATGGCACCCGAAGGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGAGAGTTTTGATGACATGGGCCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTATGCTTATGGTTTTGAGAAGCCATCAGCTATTCAGCAAAGGGGGATTGTTCCCTTCTGCAAAGGGCTTGATGTGATTCAGCAGGCTCAATCTGGAACAGGAAAAACTGCTACCTTCTGTTCTGGGATCCTGCAGCAACTTGACTATGGATTGGTGGAGTGCCAATCCCTGGTCCTTGCACCAACACGTGAGCTTGCCCAGCAAATTGAAAAGGTCATGCGTGCTCTTGGTGACTACTTAGGTGTCAAGGTGCATGCCTGTGTTGGTGGAACCTCTGTCCGTGAGGACCAAAGGATTCTTGCTAGTGGTGTGCATGTTGTTGTTGGCACACCTGGACGTGTGTTTGACATGCTACGTCGGCAATCTCTCCGCCCAGACCACATTAAGATGTTTGTGCTGGATGAAGCTGATGAGATGCTCTCCCGTGGTTTCAAGGATCAGATCTATGATATCTTCCAGCTCCTTCCACCAAAGATCCAGGTCGGAGTGTTCTCTGCTACCATGCCTCCTGAGGCCCTTGAGATCACCCGCAAGTTCATGAACAAGCCCGTGAGGATTCTTGTGAAGAGAGATGAGCTTACCCTTGAGGGTATCAAGCAATTCTACGTCAATGTGGAGAAGGAAGATTGGAAGCTCGACACTCTTTGTGACTTGTATGAGACACTGGCCATCACCCAGAGTGTCATCTTTGTGAACACCCGCCGCAAGGTGGACTGGCTCACCGACAAGATGAGGAGCAGGGACCACACTGTCTCTGCCACACATGGAGACATGGACCAGAACACTAGGGACATCATCATGAGGGAGTTCCGATCTGGTTCTTCCCGTGTGCTTATCACCACTGATCTGCTTGCTCGTGGTATCGATGTCCAGCAAGTCTCCCTTGTCATCAACTACGACCTGCCCACCCAGCCTGAGAACTACCTCCATCGCATTGGTCGTAGTGGTCGGTTTGGCAGGAAGGGAGTTGCCATTAACTTTGTCACCCGCGATGATGAGAGGATGCTGTTCGACATCCAGAGGTTCTACAATGTGACCATCGAGGAGCTGCCGGCCAACGTCGCTGACCTTCTCTAGATTATGTCTTAGGAAGTAAGGTTCTGGATAAAAGTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTAATATGACCAACTTTCTCGTTTGGGAGGAGTGGTAAGGACGGGGTCTATTTGAATTGTGGTTAAGGACGGCTTCCATGTTTTTCTCTTTTCCGTATGCAACTATGTTTGGAAATTTTTGTAGCTGTTAGGCTGTGCTGCTTCCTGGGCTAGCTGGGAGAGGGAGACACTACTGGAATATTTACTTTCTTTATTAAGCTATGCTTGCCTTGTGTTATTATTCCAATCTGCTCTTACATTCTTCAGCTGTTTGCAATCCGTACAAATTTTGTTCTTATTGGTAATGTGAAATCTAACTTGTTTCGAG
CDS Sequence
- >LOC_Os02g05330.1 CDS ATGGCAGGAATGGCACCCGAAGGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCAGGAACTACTGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGAGAGTTTTGATGACATGGGCCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTATGCTTATGGTTTTGAGAAGCCATCAGCTATTCAGCAAAGGGGGATTGTTCCCTTCTGCAAAGGGCTTGATGTGATTCAGCAGGCTCAATCTGGAACAGGAAAAACTGCTACCTTCTGTTCTGGGATCCTGCAGCAACTTGACTATGGATTGGTGGAGTGCCAATCCCTGGTCCTTGCACCAACACGTGAGCTTGCCCAGCAAATTGAAAAGGTCATGCGTGCTCTTGGTGACTACTTAGGTGTCAAGGTGCATGCCTGTGTTGGTGGAACCTCTGTCCGTGAGGACCAAAGGATTCTTGCTAGTGGTGTGCATGTTGTTGTTGGCACACCTGGACGTGTGTTTGACATGCTACGTCGGCAATCTCTCCGCCCAGACCACATTAAGATGTTTGTGCTGGATGAAGCTGATGAGATGCTCTCCCGTGGTTTCAAGGATCAGATCTATGATATCTTCCAGCTCCTTCCACCAAAGATCCAGGTCGGAGTGTTCTCTGCTACCATGCCTCCTGAGGCCCTTGAGATCACCCGCAAGTTCATGAACAAGCCCGTGAGGATTCTTGTGAAGAGAGATGAGCTTACCCTTGAGGGTATCAAGCAATTCTACGTCAATGTGGAGAAGGAAGATTGGAAGCTCGACACTCTTTGTGACTTGTATGAGACACTGGCCATCACCCAGAGTGTCATCTTTGTGAACACCCGCCGCAAGGTGGACTGGCTCACCGACAAGATGAGGAGCAGGGACCACACTGTCTCTGCCACACATGGAGACATGGACCAGAACACTAGGGACATCATCATGAGGGAGTTCCGATCTGGTTCTTCCCGTGTGCTTATCACCACTGATCTGCTTGCTCGTGGTATCGATGTCCAGCAAGTCTCCCTTGTCATCAACTACGACCTGCCCACCCAGCCTGAGAACTACCTCCATCGCATTGGTCGTAGTGGTCGGTTTGGCAGGAAGGGAGTTGCCATTAACTTTGTCACCCGCGATGATGAGAGGATGCTGTTCGACATCCAGAGGTTCTACAATGTGACCATCGAGGAGCTGCCGGCCAACGTCGCTGACCTTCTCTAG
Protein Sequence
- >LOC_Os02g05330.1 protein MAGMAPEGSQFDAKHYDSKMQELLHQGDNEEFFTSYDEVFESFDDMGLQENLLRGIYAYGFEKPSAIQQRGIVPFCKGLDVIQQAQSGTGKTATFCSGILQQLDYGLVECQSLVLAPTRELAQQIEKVMRALGDYLGVKVHACVGGTSVREDQRILASGVHVVVGTPGRVFDMLRRQSLRPDHIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQLLPPKIQVGVFSATMPPEALEITRKFMNKPVRILVKRDELTLEGIKQFYVNVEKEDWKLDTLCDLYETLAITQSVIFVNTRRKVDWLTDKMRSRDHTVSATHGDMDQNTRDIIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTQPENYLHRIGRSGRFGRKGVAINFVTRDDERMLFDIQRFYNVTIEELPANVADLL*