Gene Details:
- MSU gene ID: LOC_Os02g20870
- RAPdb gene ID: Os02g0312800
- Gene Symbol: OsSNI1
- Genome: MSU7 , IRGSP-1.0
- Species: Oryza sativa
Functional Descriptions:
Function-related keywords:
Literature:
- Negative regulator of E2F transcription factors links cell cycle checkpoint and DNA damage repair . DOI: 10.1073/pnas.1720094115 ; PMID: 29610335
Related News:
Gene Resources:
Sequences:
cDNA Sequence
- >LOC_Os02g20870.2 cDNA CTTTCTTGTTCCCGCCTCGCCCGCCGTTAACCCCCGAAACCCCGCTCAAAACCCCCCGAAGAAAATGGCGACCCGCCGCGCGCCGCCACCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGATGGCAGCATCGAGGAGAACGCGATGGCCATCCTCGACACCGCCGGCATCAAGGACGCCCGCGACCTCCACGACGACCGTACCCCCGCCTCCCAGTCCCCTCCCTCTCCCTTTCCCCCGTTTCCAATCTCTCCGGAATTTTCCTAGGTTTCTCTCTCTCTTGCGCCCAACCTGGTGATTCCCGGCGCTAATAGATCTTTTGCGCGCTCCCCCACAGGTTGCGCCTTCCTGGAGACCGTGCGCTCCGCCTGCCTTGCCGCCGACAGCCCCTCTCCCCCTTCGTGGAGAATGTATAATGCCGTTTTCCAGATTCTTCAAGACAGCAGCTCGCTGGAGCTTACCATGGCAAGTCTCCACCTCTTAATGGAGTTGGGGAAGCAATACCCTAGAGCATATTTGACCGATTCTGGTTCTGGCCAAGCTTTAGTGGCAGTTAAAGAGGCATGGTCACCATTTCACCTTCGCAGCGATGTTGGTTGTGGTGAGATTGGGGGAAACAACAGGCACTTAGACCACCTCTTCGATTCTTCAAGATTTTCATCATTAATCGAGGATATGGTTGAAACAGCTAATGACACAGATGCTAATAATGGAATTGAGCATATAAAGAACATGGTGCTGCTTGAATATCTTGTCAGCACCCTTGAGGCTGATTTTGTACCTCGTCAGATTGCATATAAAGAGTCATTAGACTGGGTAATTTTCAGGGAATCTCTTCTACAGATGCTTCTGGTTTCACGGAAGGTGGCATTCAAATCTTTAGTAAAGAACTGCATATCTTTTCTGCTCAATCAATATAATCAGGGAGTTGAAGATGGCATATCTTCCAAAGAAGGTTCTGCTAAATCAGCACCTGATCTAGAATCTTCCTTAGCTATCATATCTTTTGAATTCGAAAGAAAAGCTCTTGCATCAGTTCAGAAACTTTTCACTATGGTTATGAACCTTGACTTGATTAGAAAAGAAGCAGACACAATGGGTCTGACTTCAAGAGCTGATGGGTGCAGGAATCCTATCTTGGACGTTATTTTAGATGAGCTAACTTACAACATAAGCTATTTATCTCCATTTCTTCTGATCTTTGTGGAATGGAAGTGGAAATTGGAGATTATACTTCAGTACTTTTCAAAATATTGTGGCAAGCCTGCAGTTCGTACTCGGAGATCTGATAATTCACAACACGATTTGACATTGGAAAATGTACTGACTTTATTTTCAACGGCTGCAACCACAAAAGCCATTGTTAAAAAGATGAGTTCAGAAGTTGTCCAGCTGCTCTTAGCAAACGCATACCAGGTCTGCCTTCATCTGGAATGTGATTCTAGCAAAGATAGTGATACAACAAAGAAGATTGGAGCGACTCTCCTACAGATATCTGAGAGTTTTGTATCTGCTTTTCATAATATGAGAAAAATCAACCCGGATATGCAGCTCTCGCCGTTTGAGAAAGAAGCTCTCTTCACTGCTGCGTCAATGGCTAGAGTTCTAAAGAACAAACAAAGATAGGGAGCAGGCTTTGGAAGTGCACATTCGTTTGATGATTTGCTCTGGCAACTTGTTTTGGTCTTTAAGATAGTAGCATCCTTTGCCATCTCATCTATCGTATGCATAATTATGCTTACCTCTGTTCATATTAGTTTATCCTACTACTATCTATCTGGAGTTAATGTACATAATTGGAGCATCTGTGTTGAATATCCATTTCACTTAACACTTCCTGATATCTGAATGAGGATATCAACTGCTTGGAATTTCCTGATTGGTTAAAAATTCCCAAAATGTGCTTGCTCAGTTAATTCCTCTCTCAAGGGGGCTGAAGGGAATTGGAGGAATCAATGGTTCACGTCATAATAACAGTCAAAGCAAAACTTGTATTTATGGGCATGTCAAGTTGTCAACGTTGAGGTAGTGTACTAAGCTTCAATCCACACACACAAACACACACGAGCCATGCATATGTGAAGGAACAACTTCTTTCTCCTGTGGTTGTACTATTATGCATACGATTTGCATTTCATTGTAGTGCCAAAAGAACAGACTCTTTATATGGTAGCTCACTTTGTACGGGATATTCTATTGGTTCCGGTGTCATCTGTCTCTTCAAAGCAAACATTTAGGAAGGTTAGAAGAATTATTGAAGAACAGAGATCATGTCTTGCACTCGAGATAAATGATGCAATCTTTTATCGTAAAGACTAGATGGAGGTAGATCAATGG
- >LOC_Os02g20870.1 cDNA CTTTCTTGTTCCCGCCTCGCCCGCCGTTAACCCCCGAAACCCCGCTCAAAACCCCCCGAAGAAAATGGCGACCCGCCGCGCGCCGCCACCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGATGGCAGCATCGAGGAGAACGCGATGGCCATCCTCGACACCGCCGGCATCAAGGACGCCCGCGACCTCCACGACGACCGTACCCCCGCCTCCCAGTCCCCTCCCTCTCCCTTTCCCCCGTTTCCAATCTCTCCGGAATTTTCCTAGGTTTCTCTCTCTCTTGCGCCCAACCTGGTGATTCCCGGCGCTAATAGATCTTTTGCGCGCTCCCCCACAGGTTGCGCCTTCCTGGAGACCGTGCGCTCCGCCTGCCTTGCCGCCGACAGCCCCTCTCCCCCTTCGTGGAGAATGTATAATGCCGTTTTCCAGATTCTTCAAGACAGCAGCTCGCTGGAGCTTACCATGGCAAGTCTCCACCTCTTAATGGAGTTGGGGAAGCAATACCCTAGAGCATATTTGACCGATTCTGGTTCTGGCCAAGCTTTAGTGGCAGTTAAAGAGGCATGGTCACCATTTCACCTTCGCAGCGATGTTGGTTGTGGTGAGATTGGGGGAAACAACAGGCACTTAGACCACCTCTTCGATTCTTCAAGATTTTCATCATTAATCGAGGATATGGTTGAAACAGCTAATGACACAGATGCTAATAATGGAATTGAGCATATAAAGAACATGGTGCTGCTTGAATATCTTGTCAGCACCCTTGAGGCTGATTTTGTACCTCGTCAGATTGCATATAAAGAGTCATTAGACTGGGTAATTTTCAGGGAATCTCTTCTACAGATGCTTCTGGTTTCACGGAAGGTGGCATTCAAATCTTTAGTAAAGAACTGCATATCTTTTCTGCTCAATCAATATAATCAGGGAGTTGAAGATGGCATATCTTCCAAAGAAGGTTCTGCTAAATCAGCACCTGATCTAGAATCTTCCTTAGCTATCATATCTTTTGAATTCGAAAGAAAAGCTCTTGCATCAGTTCAGAAACTTTTCACTATGGTTATGAACCTTGACTTGATTAGAAAAGAAGCAGACACAATGGGTCTGACTTCAAGAGCTGATGGGTGCAGGAATCCTATCTTGGACGTTATTTTAGATGAGCTAACTTACAACATAAGCTATTTATCTCCATTTCTTCTGATCTTTGTGGAATGGAAGTGGAAATTGGAGATTATACTTCAGTACTTTTCAAAATATTGTGGCAAGCCTGCAGTTCGTACTCGGAGATCTGATAATTCACAACACGATTTGACATTGGAAAATGTACTGACTTTATTTTCAACGGCTGCAACCACAAAAGCCATTGTTAAAAAGATGAGTTCAGAAGTTGTCCAGCTGCTCTTAGCAAACGCATACCAGGTCTGCCTTCATCTGGAATGTGATTCTAGCAAAGATAGTGATACAACAAAGAAGATTGGAGCGACTCTCCTACAGATATCTGAGAGTTTTGTATCTGCTTTTCATAATATGAGAAAAATCAACCCGGATATGCAGCTCTCGCCGTTTGAGAAAGAAGCTCTCTTCACTGCTGCGTCAATGGCTAGAGTTCTAAAGAACAAACAAAGATAGGGAGCAGGCTTTGGAAGTGCACATTCGTTTGATGATTTGCTCTGGCAACTTGTTTTGGTCTTTAAGATAGTAGCATCCTTTGCCATCTCATCTATCGTATGCATAATTATGCTTACCTCTGTTCATATTAGTTTATCCTACTACTATCTATCTGGAGTTAATGTACATAATTGGAGCATCTGTGTTGAATATCCATTTCACTTAACACTTCCTGATATCTGAATGAGGATATCAACTGCTTGGAATTTCCTGATTGGTTAAAAATTCCCAAAATGTGCTTGCTCAGTTAATTCCTCTCTCAAGGGGGCTGAAGGGAATTGGAGGAATCAATGGTTCACGTCATAATAACAGTCAAAGCAAAACTTGTATTTATGGGCATGTCAAGTTGTCAACGTTGAGGTAGTGTACTAAGCTTCAATCCACACACACAAACACACACGAGCCATGCATATGTGAAGGAACAACTTCTTTCTCCTGTGGTTGTACTATTATGCATACGATTTGCATTTCATTGTAGTGCCAAAAGAACAGACTCTTTATATGGTAGCTCACTTTGTACGGGATATTCTATTGGTTCCGGTGTCATCTGTCTCTTCAAAGCAAACATTTAGGAAGGTTAGAAGAATTATTGAAGAACAGAGATCATGTCTTGCACTCGAGATAAATGATGCAATCTTTTATCGTAAAGACTAGATGGAGGTAGATCAATGG
CDS Sequence
- >LOC_Os02g20870.2 CDS ATGTATAATGCCGTTTTCCAGATTCTTCAAGACAGCAGCTCGCTGGAGCTTACCATGGCAAGTCTCCACCTCTTAATGGAGTTGGGGAAGCAATACCCTAGAGCATATTTGACCGATTCTGGTTCTGGCCAAGCTTTAGTGGCAGTTAAAGAGGCATGGTCACCATTTCACCTTCGCAGCGATGTTGGTTGTGGTGAGATTGGGGGAAACAACAGGCACTTAGACCACCTCTTCGATTCTTCAAGATTTTCATCATTAATCGAGGATATGGTTGAAACAGCTAATGACACAGATGCTAATAATGGAATTGAGCATATAAAGAACATGGTGCTGCTTGAATATCTTGTCAGCACCCTTGAGGCTGATTTTGTACCTCGTCAGATTGCATATAAAGAGTCATTAGACTGGGTAATTTTCAGGGAATCTCTTCTACAGATGCTTCTGGTTTCACGGAAGGTGGCATTCAAATCTTTAGTAAAGAACTGCATATCTTTTCTGCTCAATCAATATAATCAGGGAGTTGAAGATGGCATATCTTCCAAAGAAGGTTCTGCTAAATCAGCACCTGATCTAGAATCTTCCTTAGCTATCATATCTTTTGAATTCGAAAGAAAAGCTCTTGCATCAGTTCAGAAACTTTTCACTATGGTTATGAACCTTGACTTGATTAGAAAAGAAGCAGACACAATGGGTCTGACTTCAAGAGCTGATGGGTGCAGGAATCCTATCTTGGACGTTATTTTAGATGAGCTAACTTACAACATAAGCTATTTATCTCCATTTCTTCTGATCTTTGTGGAATGGAAGTGGAAATTGGAGATTATACTTCAGTACTTTTCAAAATATTGTGGCAAGCCTGCAGTTCGTACTCGGAGATCTGATAATTCACAACACGATTTGACATTGGAAAATGTACTGACTTTATTTTCAACGGCTGCAACCACAAAAGCCATTGTTAAAAAGATGAGTTCAGAAGTTGTCCAGCTGCTCTTAGCAAACGCATACCAGGTCTGCCTTCATCTGGAATGTGATTCTAGCAAAGATAGTGATACAACAAAGAAGATTGGAGCGACTCTCCTACAGATATCTGAGAGTTTTGTATCTGCTTTTCATAATATGAGAAAAATCAACCCGGATATGCAGCTCTCGCCGTTTGAGAAAGAAGCTCTCTTCACTGCTGCGTCAATGGCTAGAGTTCTAAAGAACAAACAAAGATAG
- >LOC_Os02g20870.1 CDS ATGTATAATGCCGTTTTCCAGATTCTTCAAGACAGCAGCTCGCTGGAGCTTACCATGGCAAGTCTCCACCTCTTAATGGAGTTGGGGAAGCAATACCCTAGAGCATATTTGACCGATTCTGGTTCTGGCCAAGCTTTAGTGGCAGTTAAAGAGGCATGGTCACCATTTCACCTTCGCAGCGATGTTGGTTGTGGTGAGATTGGGGGAAACAACAGGCACTTAGACCACCTCTTCGATTCTTCAAGATTTTCATCATTAATCGAGGATATGGTTGAAACAGCTAATGACACAGATGCTAATAATGGAATTGAGCATATAAAGAACATGGTGCTGCTTGAATATCTTGTCAGCACCCTTGAGGCTGATTTTGTACCTCGTCAGATTGCATATAAAGAGTCATTAGACTGGGTAATTTTCAGGGAATCTCTTCTACAGATGCTTCTGGTTTCACGGAAGGTGGCATTCAAATCTTTAGTAAAGAACTGCATATCTTTTCTGCTCAATCAATATAATCAGGGAGTTGAAGATGGCATATCTTCCAAAGAAGGTTCTGCTAAATCAGCACCTGATCTAGAATCTTCCTTAGCTATCATATCTTTTGAATTCGAAAGAAAAGCTCTTGCATCAGTTCAGAAACTTTTCACTATGGTTATGAACCTTGACTTGATTAGAAAAGAAGCAGACACAATGGGTCTGACTTCAAGAGCTGATGGGTGCAGGAATCCTATCTTGGACGTTATTTTAGATGAGCTAACTTACAACATAAGCTATTTATCTCCATTTCTTCTGATCTTTGTGGAATGGAAGTGGAAATTGGAGATTATACTTCAGTACTTTTCAAAATATTGTGGCAAGCCTGCAGTTCGTACTCGGAGATCTGATAATTCACAACACGATTTGACATTGGAAAATGTACTGACTTTATTTTCAACGGCTGCAACCACAAAAGCCATTGTTAAAAAGATGAGTTCAGAAGTTGTCCAGCTGCTCTTAGCAAACGCATACCAGGTCTGCCTTCATCTGGAATGTGATTCTAGCAAAGATAGTGATACAACAAAGAAGATTGGAGCGACTCTCCTACAGATATCTGAGAGTTTTGTATCTGCTTTTCATAATATGAGAAAAATCAACCCGGATATGCAGCTCTCGCCGTTTGAGAAAGAAGCTCTCTTCACTGCTGCGTCAATGGCTAGAGTTCTAAAGAACAAACAAAGATAG
Protein Sequence
- >LOC_Os02g20870.2 protein MYNAVFQILQDSSSLELTMASLHLLMELGKQYPRAYLTDSGSGQALVAVKEAWSPFHLRSDVGCGEIGGNNRHLDHLFDSSRFSSLIEDMVETANDTDANNGIEHIKNMVLLEYLVSTLEADFVPRQIAYKESLDWVIFRESLLQMLLVSRKVAFKSLVKNCISFLLNQYNQGVEDGISSKEGSAKSAPDLESSLAIISFEFERKALASVQKLFTMVMNLDLIRKEADTMGLTSRADGCRNPILDVILDELTYNISYLSPFLLIFVEWKWKLEIILQYFSKYCGKPAVRTRRSDNSQHDLTLENVLTLFSTAATTKAIVKKMSSEVVQLLLANAYQVCLHLECDSSKDSDTTKKIGATLLQISESFVSAFHNMRKINPDMQLSPFEKEALFTAASMARVLKNKQR*
- >LOC_Os02g20870.1 protein MYNAVFQILQDSSSLELTMASLHLLMELGKQYPRAYLTDSGSGQALVAVKEAWSPFHLRSDVGCGEIGGNNRHLDHLFDSSRFSSLIEDMVETANDTDANNGIEHIKNMVLLEYLVSTLEADFVPRQIAYKESLDWVIFRESLLQMLLVSRKVAFKSLVKNCISFLLNQYNQGVEDGISSKEGSAKSAPDLESSLAIISFEFERKALASVQKLFTMVMNLDLIRKEADTMGLTSRADGCRNPILDVILDELTYNISYLSPFLLIFVEWKWKLEIILQYFSKYCGKPAVRTRRSDNSQHDLTLENVLTLFSTAATTKAIVKKMSSEVVQLLLANAYQVCLHLECDSSKDSDTTKKIGATLLQISESFVSAFHNMRKINPDMQLSPFEKEALFTAASMARVLKNKQR*