Gene Details:
- MSU gene ID: LOC_Os04g53440
- RAPdb gene ID: Os04g0625800
- Gene Symbol: RBP-L
- Genome: MSU7 , IRGSP-1.0
- Species: Oryza sativa
Functional Descriptions:
- Transcriptome analysis showed that RBP-L knockdown greatly affected the expression of prolamine family genes and several classes of transcription factors.
- Moreover, distinct from RBP-P, RBP-L exhibits additional regulatory roles in development, either directly through its binding to corresponding RNAs or indirectly through its effect on transcription factors.
- Reduced amounts of RBP-L caused partial mislocalization of glutelin and prolamine RNAs and conferred other general growth defects, including dwarfism, late flowering, and smaller seeds.
Function-related keywords:
Literature:
- Targeted Endoplasmic Reticulum Localization of Storage Protein mRNAs Requires the RNA-Binding Protein RBP-L . DOI: 10.1104/pp.18.01434 ; PMID: 30659066
Related News:
Gene Resources:
Sequences:
cDNA Sequence
- >LOC_Os04g53440.2 cDNA TCTCAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCGTTCGTGCGTGCTAGCTAGGGCATCTCGTCGCATTGATGCAGCAGCCGCCGTCGCAGCCGCAGCCCGGCATGGGCGGCCCGCCTCCGCCGCCACAGGGCGCGGCGGGGCAGCCGCCGCAGTGGGGCGCGATCCCGCCGCCGATGCCGCCGCACCAGTACGGCGCGCCGCCGCCCCAGCAGCCGCCGGCGATGTGGGGCCAGCCCCCGCCGCAGGCGCACTACGGGCAGGTGCCCCCGCCCCAGCCGTACTACGCCGCGCCACCGCCGCAGGCGATGCCCGCCCCCGCGGCCGCGGACGAGGTGAAGACGCTCTGGATCGGCGACCTGCAGCCCTGGATGGACGAGAGCTACATCTACAACTGCTTCGCGGCCACCGGGGAGGTTCAATCTGTGAAGCTTATCCGGGACAAACAAAGTGGACAGCTTCAGGGTTATGGCTTTGTTGAGTTTACAAGTCGTGCAGCTGCTGATCGAATTCTTCAGACTTATAATGGACAGATGATGCCGAATGTTGAGATGGTCTTCCGATTGAATTGGGCCAGTGCTGGCGAGAAGCGTGATGATACCCCTGACTACACCATTTTTGTCGGGGATTTGGCTGCAGATGTTACAGACTACCTACTACAAGAGACATTCAGGGTCCATTACCCTTCGGTTAAGGGTGCAAAAGTTGTAACTGACAAAATGACAATGCGTTCAAAGGGTTATGGGTTTGTGAAATTTGGTGATCCTACAGAGCAAGCTCGTGCAATGACTGAAATGAATGGAATGCTTTGCTCTTCCAGACCGATGCGTATTGGTCCAGCGGCAAATAAGAAAACAACAGGGGTTCAGGAGAGAGTACCAAATGCTCAAGGAGCTCAGTCTGAGAATGATCCTAACAATACCACCATATTCGTTGGTGGTCTTGACCCCAACGTCACTGAAGATGTCTTGAAACAAGTTTTCGCTCCTTATGGAGAAGTTGTCCATGTTAAGATTCCTGTTGGGAAAAGATGTGGTTTTGTTCAATATGTTAACAGGCCTTCTGCTGAGCAAGCACTGGCAGTGCTACAAGGGACCTTGATTGGTGGGCAGAATGTTAGACTTTCGTGGGGTCGAAGCCTTTCAAACAAACAGCCTCAGCACGACTCGAATCAGTGGGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGGTTACTATGGTGGCTATGGACAAGGTTATGAGGCTTATGGTGGGTATGCACAACCTCAGGATCCTAACATGTATGGTTATGGAGCCTATGCTGGTTATCCCAATTACCAACAGCAACAAGTAGCACAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGTGAGCCCTGTTTGATCGATCGCGTCTTTGGGCTGTGAGGCACACAACCCATTTCAAGCTACAGCTTTAGCTATGTTATTGCTATTCTCAATAGAGAGACGGTTTCTGAAGACTCCAGATTTCGATTGAGGTTTTAATGTATGAACTGTATTATGATTATGAACAACGGATGCTGCCATATCGTGGTTCCTATATTGAGTCATGTATTTTGAAAACATATCCTCTGTTTCCATCTCACCCTTATCATCGATTATTATTATTGCTATGTACCGTTTGTTTCCC
- >LOC_Os04g53440.1 cDNA TCTCAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCGTTCGTGCGTGCTAGCTAGGGCATCTCGTCGCATTGATGCAGCAGCCGCCGTCGCAGCCGCAGCCCGGCATGGGCGGCCCGCCTCCGCCGCCACAGGGCGCGGCGGGGCAGCCGCCGCAGTGGGGCGCGATCCCGCCGCCGATGCCGCCGCACCAGTACGGCGCGCCGCCGCCCCAGCAGCCGCCGGCGATGTGGGGCCAGCCCCCGCCGCAGGCGCACTACGGGCAGGTGCCCCCGCCCCAGCCGTACTACGCCGCGCCACCGCCGCAGGCGATGCCCGCCCCCGCGGCCGCGGACGAGGTGAAGACGCTCTGGATCGGCGACCTGCAGCCCTGGATGGACGAGAGCTACATCTACAACTGCTTCGCGGCCACCGGGGAGGTTCAATCTGTGAAGCTTATCCGGGACAAACAAAGTGGACAGCTTCAGGGTTATGGCTTTGTTGAGTTTACAAGTCGTGCAGCTGCTGATCGAATTCTTCAGACTTATAATGGACAGATGATGCCGAATGTTGAGATGGTCTTCCGATTGAATTGGGCCAGTGCTGGCGAGAAGCGTGATGATACCCCTGACTACACCATTTTTGTCGGGGATTTGGCTGCAGATGTTACAGACTACCTACTACAAGAGACATTCAGGGTCCATTACCCTTCGGTTAAGGGTGCAAAAGTTGTAACTGACAAAATGACAATGCGTTCAAAGGGTTATGGGTTTGTGAAATTTGGTGATCCTACAGAGCAAGCTCGTGCAATGACTGAAATGAATGGAATGCTTTGCTCTTCCAGACCGATGCGTATTGGTCCAGCGGCAAATAAGAAAACAACAGGGGTTCAGGAGAGAGTACCAAATGCTCAAGGAGCTCAGTCTGAGAATGATCCTAACAATACCACCATATTCGTTGGTGGTCTTGACCCCAACGTCACTGAAGATGTCTTGAAACAAGTTTTCGCTCCTTATGGAGAAGTTGTCCATGTTAAGATTCCTGTTGGGAAAAGATGTGGTTTTGTTCAATATGTTAACAGGCCTTCTGCTGAGCAAGCACTGGCAGTGCTACAAGGGACCTTGATTGGTGGGCAGAATGTTAGACTTTCGTGGGGTCGAAGCCTTTCAAACAAACAGCCTCAGCACGACTCGAATCAGTGGGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGGTTACTATGGTGGCTATGGACAAGGTTATGAGGCTTATGGTGGGTATGCACAACCTCAGGATCCTAACATGTATGGTTATGGAGCCTATGCTGGTTATCCCAATTACCAACAGCAACAAGTAGCACAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGTGAGCCCTGTTTGATCGATCGCGTCTTTGGGCTGTGAGGCACACAACCCATTTCAAGCTACAGCTTTAGCTATGTTATTGCTATTCTCAATAGAGAGACGGTTTCTGAAGACTCCAGATTTCGATTGAGGTTTTAATGTATGAACTGTATTATGATTATGAACAACGGATGCTGCCATATCGTGGTTCCTATATTGAGTCATGTATTTTGAAAACATATCCTCTGTTTCCATCTCACCCTTATCATCGATTATTATTATTGCTATGTACCGTTTGTTTCCC
CDS Sequence
- >LOC_Os04g53440.2 CDS ATGCAGCAGCCGCCGTCGCAGCCGCAGCCCGGCATGGGCGGCCCGCCTCCGCCGCCACAGGGCGCGGCGGGGCAGCCGCCGCAGTGGGGCGCGATCCCGCCGCCGATGCCGCCGCACCAGTACGGCGCGCCGCCGCCCCAGCAGCCGCCGGCGATGTGGGGCCAGCCCCCGCCGCAGGCGCACTACGGGCAGGTGCCCCCGCCCCAGCCGTACTACGCCGCGCCACCGCCGCAGGCGATGCCCGCCCCCGCGGCCGCGGACGAGGTGAAGACGCTCTGGATCGGCGACCTGCAGCCCTGGATGGACGAGAGCTACATCTACAACTGCTTCGCGGCCACCGGGGAGGTTCAATCTGTGAAGCTTATCCGGGACAAACAAAGTGGACAGCTTCAGGGTTATGGCTTTGTTGAGTTTACAAGTCGTGCAGCTGCTGATCGAATTCTTCAGACTTATAATGGACAGATGATGCCGAATGTTGAGATGGTCTTCCGATTGAATTGGGCCAGTGCTGGCGAGAAGCGTGATGATACCCCTGACTACACCATTTTTGTCGGGGATTTGGCTGCAGATGTTACAGACTACCTACTACAAGAGACATTCAGGGTCCATTACCCTTCGGTTAAGGGTGCAAAAGTTGTAACTGACAAAATGACAATGCGTTCAAAGGGTTATGGGTTTGTGAAATTTGGTGATCCTACAGAGCAAGCTCGTGCAATGACTGAAATGAATGGAATGCTTTGCTCTTCCAGACCGATGCGTATTGGTCCAGCGGCAAATAAGAAAACAACAGGGGTTCAGGAGAGAGTACCAAATGCTCAAGGAGCTCAGTCTGAGAATGATCCTAACAATACCACCATATTCGTTGGTGGTCTTGACCCCAACGTCACTGAAGATGTCTTGAAACAAGTTTTCGCTCCTTATGGAGAAGTTGTCCATGTTAAGATTCCTGTTGGGAAAAGATGTGGTTTTGTTCAATATGTTAACAGGCCTTCTGCTGAGCAAGCACTGGCAGTGCTACAAGGGACCTTGATTGGTGGGCAGAATGTTAGACTTTCGTGGGGTCGAAGCCTTTCAAACAAACAGCCTCAGCACGACTCGAATCAGTGGGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGGTTACTATGGTGGCTATGGACAAGGTTATGAGGCTTATGGTGGGTATGCACAACCTCAGGATCCTAACATGTATGGTTATGGAGCCTATGCTGGTTATCCCAATTACCAACAGCAACAAGTAGCACAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGTGA
- >LOC_Os04g53440.1 CDS ATGCAGCAGCCGCCGTCGCAGCCGCAGCCCGGCATGGGCGGCCCGCCTCCGCCGCCACAGGGCGCGGCGGGGCAGCCGCCGCAGTGGGGCGCGATCCCGCCGCCGATGCCGCCGCACCAGTACGGCGCGCCGCCGCCCCAGCAGCCGCCGGCGATGTGGGGCCAGCCCCCGCCGCAGGCGCACTACGGGCAGGTGCCCCCGCCCCAGCCGTACTACGCCGCGCCACCGCCGCAGGCGATGCCCGCCCCCGCGGCCGCGGACGAGGTGAAGACGCTCTGGATCGGCGACCTGCAGCCCTGGATGGACGAGAGCTACATCTACAACTGCTTCGCGGCCACCGGGGAGGTTCAATCTGTGAAGCTTATCCGGGACAAACAAAGTGGACAGCTTCAGGGTTATGGCTTTGTTGAGTTTACAAGTCGTGCAGCTGCTGATCGAATTCTTCAGACTTATAATGGACAGATGATGCCGAATGTTGAGATGGTCTTCCGATTGAATTGGGCCAGTGCTGGCGAGAAGCGTGATGATACCCCTGACTACACCATTTTTGTCGGGGATTTGGCTGCAGATGTTACAGACTACCTACTACAAGAGACATTCAGGGTCCATTACCCTTCGGTTAAGGGTGCAAAAGTTGTAACTGACAAAATGACAATGCGTTCAAAGGGTTATGGGTTTGTGAAATTTGGTGATCCTACAGAGCAAGCTCGTGCAATGACTGAAATGAATGGAATGCTTTGCTCTTCCAGACCGATGCGTATTGGTCCAGCGGCAAATAAGAAAACAACAGGGGTTCAGGAGAGAGTACCAAATGCTCAAGGAGCTCAGTCTGAGAATGATCCTAACAATACCACCATATTCGTTGGTGGTCTTGACCCCAACGTCACTGAAGATGTCTTGAAACAAGTTTTCGCTCCTTATGGAGAAGTTGTCCATGTTAAGATTCCTGTTGGGAAAAGATGTGGTTTTGTTCAATATGTTAACAGGCCTTCTGCTGAGCAAGCACTGGCAGTGCTACAAGGGACCTTGATTGGTGGGCAGAATGTTAGACTTTCGTGGGGTCGAAGCCTTTCAAACAAACAGCCTCAGCACGACTCGAATCAGTGGGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGGTTACTATGGTGGCTATGGACAAGGTTATGAGGCTTATGGTGGGTATGCACAACCTCAGGATCCTAACATGTATGGTTATGGAGCCTATGCTGGTTATCCCAATTACCAACAGCAACAAGTAGCACAGCAGCAGCCGCCGCAGCAGTGA
Protein Sequence
- >LOC_Os04g53440.2 protein MQQPPSQPQPGMGGPPPPPQGAAGQPPQWGAIPPPMPPHQYGAPPPQQPPAMWGQPPPQAHYGQVPPPQPYYAAPPPQAMPAPAAADEVKTLWIGDLQPWMDESYIYNCFAATGEVQSVKLIRDKQSGQLQGYGFVEFTSRAAADRILQTYNGQMMPNVEMVFRLNWASAGEKRDDTPDYTIFVGDLAADVTDYLLQETFRVHYPSVKGAKVVTDKMTMRSKGYGFVKFGDPTEQARAMTEMNGMLCSSRPMRIGPAANKKTTGVQERVPNAQGAQSENDPNNTTIFVGGLDPNVTEDVLKQVFAPYGEVVHVKIPVGKRCGFVQYVNRPSAEQALAVLQGTLIGGQNVRLSWGRSLSNKQPQHDSNQWGAGAGAGGYYGGYGQGYEAYGGYAQPQDPNMYGYGAYAGYPNYQQQQVAQQQPPQQ*
- >LOC_Os04g53440.1 protein MQQPPSQPQPGMGGPPPPPQGAAGQPPQWGAIPPPMPPHQYGAPPPQQPPAMWGQPPPQAHYGQVPPPQPYYAAPPPQAMPAPAAADEVKTLWIGDLQPWMDESYIYNCFAATGEVQSVKLIRDKQSGQLQGYGFVEFTSRAAADRILQTYNGQMMPNVEMVFRLNWASAGEKRDDTPDYTIFVGDLAADVTDYLLQETFRVHYPSVKGAKVVTDKMTMRSKGYGFVKFGDPTEQARAMTEMNGMLCSSRPMRIGPAANKKTTGVQERVPNAQGAQSENDPNNTTIFVGGLDPNVTEDVLKQVFAPYGEVVHVKIPVGKRCGFVQYVNRPSAEQALAVLQGTLIGGQNVRLSWGRSLSNKQPQHDSNQWGAGAGAGGYYGGYGQGYEAYGGYAQPQDPNMYGYGAYAGYPNYQQQQVAQQQPPQQ*