Gene Details:
- MSU gene ID: LOC_Os06g48750
- RAPdb gene ID: Os06g0701100
- Gene Symbol: eIF-4a EIF4A
- Genome: MSU7 , IRGSP-1.0
- Species: Oryza sativa
Functional Descriptions:
Function-related keywords:
Literature:
- Structure, organization and putative function of the genes identified within a 23.9-kb fragment from Arabidopsis thaliana chromosome IV . DOI: 10.1016/s0378-1119(97)00374-0 ; PMID: 9358062
Related News:
Gene Resources:
- NCBI ID: D12627
- UniProt accessions:
Sequences:
cDNA Sequence
- >LOC_Os06g48750.1 cDNA AAACCCTCTTGTTTCTCTCTCCTGCTCCCCCCCCAACGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGAATCCGAGACCCCCATCTCGGATTCACCTCTCCCGCCTCCGGCCTCCGTCACCGTCTCCCCACGCGCGTCAGTCATGGCGGGAATGGCACCAGAGGGATCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGATTCTAAAATGCAGGAGCTTCTGAACCAAGGTGAAACCGAGGAGTTCTTCACATCTTATGATGAAGTTCATGAGAGTTTTGATGACATGGGTCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTATGCCTATGGTTTCGAGAAGCCTTCAGCCATTCAGCAAAGGGGTATTGTCCCTTTCTGCAAGGGTCTTGATGTGATTCAGCAAGCTCAGTCAGGAACAGGAAAGACTGCCACCTTCTGTTCTGGAATTTTGCAGCAACTTGACTATGCTGTGGTTGAGTGCCAGGCCTTGGTCCTTGCTCCTACTCGTGAGCTTGCACAGCAAATTGAGAAAGTCATGCGCGCACTTGGTGACTATCTGGGTGTGAAGGTTCATGCTTGTGTTGGAGGTACTTCTGTTCGTGAGGACCAAAGGATTCTTGCAAGTGGAGTGCATGTTGTTGTTGGAACACCTGGTCGTGTGTTTGACATGCTGCGTAGGCAGTCCCTCCGTCCTGATTACATCAAGATGTTTGTCCTTGATGAAGCTGATGAAATGCTTTCTCGTGGTTTCAAGGATCAGATTTATGATATCTTCCAGCTCCTCCCGTCAAAGATCCAAGTTGGTGTGTTCTCTGCTACAATGCCCCCTGAGGCCCTTGAGATCACCCGTAAATTCATGAACAAGCCTGTGCGGATCCTTGTGAAGAGGGATGAGCTCACTCTTGAGGGTATCAAACAGTTTTATGTCAATGTGGAGAAGGAAGAATGGAAGCTTGACACACTCTGTGACCTGTATGAGACACTGGCCATCACGCAGAGTGTCATCTTTGTGAACACCCGCCGCAAGGTGGACTGGCTCACTGATAAGATGAGGGGCAGGGATCACACAGTTTCTGCTACCCATGGTGACATGGACCAGAACACTAGGGACATCATCATGAGGGAGTTCCGATCTGGTTCTTCCCGTGTGCTCATTACCACGGACCTTCTTGCCCGTGGTATTGATGTCCAGCAGGTGTCCCTTGTCATCAACTATGATCTGCCGACCCAACCTGAGAACTACCTGCATCGCATTGGTCGTAGTGGTCGTTTTGGTAGGAAAGGTGTTGCCATTAACTTTGTGACCCGTGACGATGAGAGGATGCTGTTTGACATCCAGAGGTTCTACAATGTGGTGATTGAGGAGCTGCCGGCCAACGTCGCTGACCTTCTGTGATCAAGTTCAGAAGAGTTATGTTAAGGGGCCTGATAAGGATTGTTTTTGTCTGAAGTATCACTGTCTTATCTGGGGGGGGGGGGAGTGATAAAGGTGGGGGTTCTGTTTTAAAAGTCACTGTGGTCGTAGACAATTTCCAAATTTTTATGCCATGTTATGGGAATTTTTGTAGTTGCTAGGCTGTGCTATGTGCTGGTGAGGAGGGAGGAGTCTTTTACTTTTATTATATCTATTGTTAAAACTATGTATGACCGAATGATGTTATTTATTTGTGTCATGGTTGACTATTTGCCATATGTATTCTGCCACCGGTCCTGCTACTGCCACTGGTATCTCGAGTGAAAACTGTTTGCTCCTCGGTGCAATAAGCCAGATAACATGTCACCTACCGGAATGCCGTTGATGTCTAGTGATGTTTTATCTGTTGATATGCATGTTTGGTTGGATACTTGCCTGGACGATTATAATAATTTTTTGAGATGTTGGCTTCATTTTGGTGAGTGAAAACA
- >LOC_Os06g48750.3 cDNA AAACCCTCTTGTTTCTCTCTCCTGCTCCCCCCCCAACGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGAATCCGAGACCCCCATCTCGGATTCACCTCTCCCGCCTCCGGCCTCCGTCACCGTCTCCCCACGCGCGTCAGTCATGGCGGGAATGGCACCAGAGGGATCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGATTCTAAAATGCAGGAGCTTCTGAACCAAGGTGAAACCGAGGAGTTCTTCACATCTTATGATGAAGTTCATGAGAGTTTTGATGACATGGGTCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTATGCCTATGGTTTCGAGAAGCCTTCAGCCATTCAGCAAAGGGGTATTGTCCCTTTCTGCAAGGGTCTTGATGTGATTCAGCAAGCTCAGTCAGGAACAGGAAAGACTGCCACCTTCTGTTCTGGAATTTTGCAGCAACTTGACTATGCTGTGGTTGAGTGCCAGGCCTTGGTCCTTGCTCCTACTCGTGAGCTTGCACAGCAAATTGAGAAAGTCATGCGCGCACTTGGTGACTATCTGGGTGTGAAGGTTCATGCTTGTGTTGGAGGTACTTCTGTTCGTGAGGACCAAAGGATTCTTGCAAGTGGAGTGCATGTTGTTGTTGGAACACCTGGTCGTGTGTTTGACATGCTGCGTAGGCAGTCCCTCCGTCCTGATTACATCAAGATGTTTGTCCTTGATGAAGCTGATGAAATGCTTTCTCGTGGTTTCAAGGATCAGATTTATGATATCTTCCAGCTCCTCCCGTCAAAGATCCAAGTTGGTGTGTTCTCTGCTACAATGCCCCCTGAGGCCCTTGAGATCACCCGTAAATTCATGAACAAGCCTGTGCGGATCCTTGTGAAGAGGGATGAGCTCACTCTTGAGGGTATCAAACAGTTTTATGTCAATGTGGAGAAGGAAGAATGGAAGCTTGACACACTCTGTGACCTGTATGAGACACTGGCCATCACGCAGAGTGTCATCTTTGTGAACACCCGCCGCAAGGTGGACTGGCTCACTGATAAGATGAGGGGCAGGGATCACACAGTTTCTGCTACCCATGGTGACATGGACCAGAACACTAGGGACATCATCATGAGGGAGTTCCGATCTGGTTCTTCCCGTGTGCTCATTACCACGGACCTTCTTGCCCGTGGTATTGATGTCCAGCAGGTGTCCCTTGTCATCAACTATGATCTGCCGACCCAACCTGAGAACTACCTGCATCGCATTGGTCGTAGTGGTCGTTTTGGTAGGAAAGGTGTTGCCATTAACTTTGTGACCCGTGACGATGAGAGGATGCTGTTTGACATCCAGAGGTTCTACAATGTGGTGATTGAGGAGCTGCCGGCCAACGTCGCTGACCTTCTGTGATCAAGTTCAGAAGAGTTATGTTAAGGGGCCTGATAAGGATTGTTTTTGTCTGAAGTATCACTGTCTTATCTGGGGGGGGGGGGAGTGATAAAGGTGGGGGTTCTGTTTTAAAAGTCACTGTGGTCGTAGACAATTTCCAAATTTTTATGCCATGTTATGGGAATTTTTGTAGTTGCTAGGCTGTGCTATGTGCTGGTGAGGAGGGAGGAGTCTTTTACTTTTATTATATCTATTGTTAAAACTATGTATGACCGAATGATGTTATTTATTTGTGTCATGGTTGACTATTTGCCATATGTATTCTGCCACCGGTCCTGCTACTGCCACTGGTATCTCGAGTGAAAACTGTTTGCTCCTCGGTGCAATAAGCCAGATAACATGTCACCTACCGGAATGCCGTTGATGTCTAGTGATGTTTTATCTGTTGATATGCATGTTTGGTTGGATACTTGCCTGGACGATTATAATAATTTTTTGAGATGTTGGCTTCATTTTGGTGAGTGAAAACA
- >LOC_Os06g48750.2 cDNA AAACCCTCTTGTTTCTCTCTCCTGCTCCCCCCCCAACGCCGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGAATCCGAGACCCCCATCTCGGATTCACCTCTCCCGCCTCCGGCCTCCGTCACCGTCTCCCCACGCGCGTCAGTCATGGCGGGAATGGCACCAGAGGGATCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGATTCTAAAATGCAGGAGCTTCTGAACCAAGGTGAAACCGAGGAGTTCTTCACATCTTATGATGAAGTTCATGAGAGTTTTGATGACATGGGTCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTATGCCTATGGTTTCGAGAAGCCTTCAGCCATTCAGCAAAGGGGTATTGTCCCTTTCTGCAAGGGTCTTGATGTGATTCAGCAAGCTCAGTCAGGAACAGGAAAGACTGCCACCTTCTGTTCTGGAATTTTGCAGCAACTTGACTATGCTGTGGTTGAGTGCCAGGCCTTGGTCCTTGCTCCTACTCGTGAGCTTGCACAGCAAATTGAGAAAGTCATGCGCGCACTTGGTGACTATCTGGGTGTGAAGGTTCATGCTTGTGTTGGAGGTACTTCTGTTCGTGAGGACCAAAGGATTCTTGCAAGTGGAGTGCATGTTGTTGTTGGAACACCTGGTCGTGTGTTTGACATGCTGCGTAGGCAGTCCCTCCGTCCTGATTACATCAAGATGTTTGTCCTTGATGAAGCTGATGAAATGCTTTCTCGTGGTTTCAAGGATCAGATTTATGATATCTTCCAGCTCCTCCCGTCAAAGATCCAAGTTGGTGTGTTCTCTGCTACAATGCCCCCTGAGGCCCTTGAGATCACCCGTAAATTCATGAACAAGCCTGTGCGGATCCTTGTGAAGAGGGATGAGCTCACTCTTGAGGGTATCAAACAGTTTTATGTCAATGTGGAGAAGGAAGAATGGAAGCTTGACACACTCTGTGACCTGTATGAGACACTGGCCATCACGCAGAGTGTCATCTTTGTGAACACCCGCCGCAAGGTGGACTGGCTCACTGATAAGATGAGGGGCAGGGATCACACAGTTTCTGCTACCCATGGTGACATGGACCAGAACACTAGGGACATCATCATGAGGGAGTTCCGATCTGGTTCTTCCCGTGTGCTCATTACCACGGACCTTCTTGCCCGTGGTATTGATGTCCAGCAGGTGTCCCTTGTCATCAACTATGATCTGCCGACCCAACCTGAGAACTACCTGCATCGCATTGGTCGTAGTGGTCGTTTTGGTAGGAAAGGTGTTGCCATTAACTTTGTGACCCGTGACGATGAGAGGATGCTGTTTGACATCCAGAGGTTCTACAATGTGGTGATTGAGGAGCTGCCGGCCAACGTCGCTGACCTTCTGTGATCAAGTTCAGAAGAGTTATGTTAAGGGGCCTGATAAGGATTGTTTTTGTCTGAAGTATCACTGTCTTATCTGGGGGGGGGGGGAGTGATAAAGGTGGGGGTTCTGTTTTAAAAGTCACTGTGGTCGTAGACAATTTCCAAATTTTTATGCCATGTTATGGGAATTTTTGTAGTTGCTAGGCTGTGCTATGTGCTGGTGAGGAGGGAGGAGTCTTTTACTTTTATTATATCTATTGTTAAAACTATGTATGACCGAATGATGTTATTTATTTGTGTCATGGTTGACTATTTGCCATATGTATTCTGCCACCGGTCCTGCTACTGCCACTGGTATCTCGAGTGAAAACTGTTTGCTCCTCGGTGCAATAAGCCAGATAACATGTCACCTACCGGAATGCCGTTGATGTCTAGTGATGTTTTATCTGTTGATATGCATGTTTGGTTGGATACTTGCCTGGACGATTATAATAATTTTTTGAGATGTTGGCTTCATTTTGGTGAGTGAAAACA
CDS Sequence
- >LOC_Os06g48750.1 CDS ATGGCGGGAATGGCACCAGAGGGATCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGATTCTAAAATGCAGGAGCTTCTGAACCAAGGTGAAACCGAGGAGTTCTTCACATCTTATGATGAAGTTCATGAGAGTTTTGATGACATGGGTCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTATGCCTATGGTTTCGAGAAGCCTTCAGCCATTCAGCAAAGGGGTATTGTCCCTTTCTGCAAGGGTCTTGATGTGATTCAGCAAGCTCAGTCAGGAACAGGAAAGACTGCCACCTTCTGTTCTGGAATTTTGCAGCAACTTGACTATGCTGTGGTTGAGTGCCAGGCCTTGGTCCTTGCTCCTACTCGTGAGCTTGCACAGCAAATTGAGAAAGTCATGCGCGCACTTGGTGACTATCTGGGTGTGAAGGTTCATGCTTGTGTTGGAGGTACTTCTGTTCGTGAGGACCAAAGGATTCTTGCAAGTGGAGTGCATGTTGTTGTTGGAACACCTGGTCGTGTGTTTGACATGCTGCGTAGGCAGTCCCTCCGTCCTGATTACATCAAGATGTTTGTCCTTGATGAAGCTGATGAAATGCTTTCTCGTGGTTTCAAGGATCAGATTTATGATATCTTCCAGCTCCTCCCGTCAAAGATCCAAGTTGGTGTGTTCTCTGCTACAATGCCCCCTGAGGCCCTTGAGATCACCCGTAAATTCATGAACAAGCCTGTGCGGATCCTTGTGAAGAGGGATGAGCTCACTCTTGAGGGTATCAAACAGTTTTATGTCAATGTGGAGAAGGAAGAATGGAAGCTTGACACACTCTGTGACCTGTATGAGACACTGGCCATCACGCAGAGTGTCATCTTTGTGAACACCCGCCGCAAGGTGGACTGGCTCACTGATAAGATGAGGGGCAGGGATCACACAGTTTCTGCTACCCATGGTGACATGGACCAGAACACTAGGGACATCATCATGAGGGAGTTCCGATCTGGTTCTTCCCGTGTGCTCATTACCACGGACCTTCTTGCCCGTGGTATTGATGTCCAGCAGGTGTCCCTTGTCATCAACTATGATCTGCCGACCCAACCTGAGAACTACCTGCATCGCATTGGTCGTAGTGGTCGTTTTGGTAGGAAAGGTGTTGCCATTAACTTTGTGACCCGTGACGATGAGAGGATGCTGTTTGACATCCAGAGGTTCTACAATGTGGTGATTGAGGAGCTGCCGGCCAACGTCGCTGACCTTCTGTGA
- >LOC_Os06g48750.3 CDS ATGGCGGGAATGGCACCAGAGGGATCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGATTCTAAAATGCAGGAGCTTCTGAACCAAGGTGAAACCGAGGAGTTCTTCACATCTTATGATGAAGTTCATGAGAGTTTTGATGACATGGGTCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTATGCCTATGGTTTCGAGAAGCCTTCAGCCATTCAGCAAAGGGGTATTGTCCCTTTCTGCAAGGGTCTTGATGTGATTCAGCAAGCTCAGTCAGGAACAGGAAAGACTGCCACCTTCTGTTCTGGAATTTTGCAGCAACTTGACTATGCTGTGGTTGAGTGCCAGGCCTTGGTCCTTGCTCCTACTCGTGAGCTTGCACAGCAAATTGAGAAAGTCATGCGCGCACTTGGTGACTATCTGGGTGTGAAGGTTCATGCTTGTGTTGGAGGTACTTCTGTTCGTGAGGACCAAAGGATTCTTGCAAGTGGAGTGCATGTTGTTGTTGGAACACCTGGTCGTGTGTTTGACATGCTGCGTAGGCAGTCCCTCCGTCCTGATTACATCAAGATGTTTGTCCTTGATGAAGCTGATGAAATGCTTTCTCGTGGTTTCAAGGATCAGATTTATGATATCTTCCAGCTCCTCCCGTCAAAGATCCAAGTTGGTGTGTTCTCTGCTACAATGCCCCCTGAGGCCCTTGAGATCACCCGTAAATTCATGAACAAGCCTGTGCGGATCCTTGTGAAGAGGGATGAGCTCACTCTTGAGGGTATCAAACAGTTTTATGTCAATGTGGAGAAGGAAGAATGGAAGCTTGACACACTCTGTGACCTGTATGAGACACTGGCCATCACGCAGAGTGTCATCTTTGTGAACACCCGCCGCAAGGTGGACTGGCTCACTGATAAGATGAGGGGCAGGGATCACACAGTTTCTGCTACCCATGGTGACATGGACCAGAACACTAGGGACATCATCATGAGGGAGTTCCGATCTGGTTCTTCCCGTGTGCTCATTACCACGGACCTTCTTGCCCGTGGTATTGATGTCCAGCAGGTGTCCCTTGTCATCAACTATGATCTGCCGACCCAACCTGAGAACTACCTGCATCGCATTGGTCGTAGTGGTCGTTTTGGTAGGAAAGGTGTTGCCATTAACTTTGTGACCCGTGACGATGAGAGGATGCTGTTTGACATCCAGAGGTTCTACAATGTGGTGATTGAGGAGCTGCCGGCCAACGTCGCTGACCTTCTGTGA
- >LOC_Os06g48750.2 CDS ATGGCGGGAATGGCACCAGAGGGATCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGATTCTAAAATGCAGGAGCTTCTGAACCAAGGTGAAACCGAGGAGTTCTTCACATCTTATGATGAAGTTCATGAGAGTTTTGATGACATGGGTCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTATGCCTATGGTTTCGAGAAGCCTTCAGCCATTCAGCAAAGGGGTATTGTCCCTTTCTGCAAGGGTCTTGATGTGATTCAGCAAGCTCAGTCAGGAACAGGAAAGACTGCCACCTTCTGTTCTGGAATTTTGCAGCAACTTGACTATGCTGTGGTTGAGTGCCAGGCCTTGGTCCTTGCTCCTACTCGTGAGCTTGCACAGCAAATTGAGAAAGTCATGCGCGCACTTGGTGACTATCTGGGTGTGAAGGTTCATGCTTGTGTTGGAGGTACTTCTGTTCGTGAGGACCAAAGGATTCTTGCAAGTGGAGTGCATGTTGTTGTTGGAACACCTGGTCGTGTGTTTGACATGCTGCGTAGGCAGTCCCTCCGTCCTGATTACATCAAGATGTTTGTCCTTGATGAAGCTGATGAAATGCTTTCTCGTGGTTTCAAGGATCAGATTTATGATATCTTCCAGCTCCTCCCGTCAAAGATCCAAGTTGGTGTGTTCTCTGCTACAATGCCCCCTGAGGCCCTTGAGATCACCCGTAAATTCATGAACAAGCCTGTGCGGATCCTTGTGAAGAGGGATGAGCTCACTCTTGAGGGTATCAAACAGTTTTATGTCAATGTGGAGAAGGAAGAATGGAAGCTTGACACACTCTGTGACCTGTATGAGACACTGGCCATCACGCAGAGTGTCATCTTTGTGAACACCCGCCGCAAGGTGGACTGGCTCACTGATAAGATGAGGGGCAGGGATCACACAGTTTCTGCTACCCATGGTGACATGGACCAGAACACTAGGGACATCATCATGAGGGAGTTCCGATCTGGTTCTTCCCGTGTGCTCATTACCACGGACCTTCTTGCCCGTGGTATTGATGTCCAGCAGGTGTCCCTTGTCATCAACTATGATCTGCCGACCCAACCTGAGAACTACCTGCATCGCATTGGTCGTAGTGGTCGTTTTGGTAGGAAAGGTGTTGCCATTAACTTTGTGACCCGTGACGATGAGAGGATGCTGTTTGACATCCAGAGGTTCTACAATGTGGTGATTGAGGAGCTGCCGGCCAACGTCGCTGACCTTCTGTGA
Protein Sequence
- >LOC_Os06g48750.1 protein MAGMAPEGSQFDAKHYDSKMQELLNQGETEEFFTSYDEVHESFDDMGLQENLLRGIYAYGFEKPSAIQQRGIVPFCKGLDVIQQAQSGTGKTATFCSGILQQLDYAVVECQALVLAPTRELAQQIEKVMRALGDYLGVKVHACVGGTSVREDQRILASGVHVVVGTPGRVFDMLRRQSLRPDYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQLLPSKIQVGVFSATMPPEALEITRKFMNKPVRILVKRDELTLEGIKQFYVNVEKEEWKLDTLCDLYETLAITQSVIFVNTRRKVDWLTDKMRGRDHTVSATHGDMDQNTRDIIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTQPENYLHRIGRSGRFGRKGVAINFVTRDDERMLFDIQRFYNVVIEELPANVADLL*
- >LOC_Os06g48750.3 protein MAGMAPEGSQFDAKHYDSKMQELLNQGETEEFFTSYDEVHESFDDMGLQENLLRGIYAYGFEKPSAIQQRGIVPFCKGLDVIQQAQSGTGKTATFCSGILQQLDYAVVECQALVLAPTRELAQQIEKVMRALGDYLGVKVHACVGGTSVREDQRILASGVHVVVGTPGRVFDMLRRQSLRPDYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQLLPSKIQVGVFSATMPPEALEITRKFMNKPVRILVKRDELTLEGIKQFYVNVEKEEWKLDTLCDLYETLAITQSVIFVNTRRKVDWLTDKMRGRDHTVSATHGDMDQNTRDIIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTQPENYLHRIGRSGRFGRKGVAINFVTRDDERMLFDIQRFYNVVIEELPANVADLL*
- >LOC_Os06g48750.2 protein MAGMAPEGSQFDAKHYDSKMQELLNQGETEEFFTSYDEVHESFDDMGLQENLLRGIYAYGFEKPSAIQQRGIVPFCKGLDVIQQAQSGTGKTATFCSGILQQLDYAVVECQALVLAPTRELAQQIEKVMRALGDYLGVKVHACVGGTSVREDQRILASGVHVVVGTPGRVFDMLRRQSLRPDYIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQLLPSKIQVGVFSATMPPEALEITRKFMNKPVRILVKRDELTLEGIKQFYVNVEKEEWKLDTLCDLYETLAITQSVIFVNTRRKVDWLTDKMRGRDHTVSATHGDMDQNTRDIIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTQPENYLHRIGRSGRFGRKGVAINFVTRDDERMLFDIQRFYNVVIEELPANVADLL*