Gene Details:
- MSU gene ID: LOC_Os10g31460
- RAPdb gene ID: Os10g0452300
- Gene Symbol: CAI1
- Genome: MSU7 , IRGSP-1.0
- Species: Oryza sativa
Functional Descriptions:
Function-related keywords:
Literature:
- Identification of novel genes differentially expressed in compatible and incompatible interactions between rice and Pseudomonas avenae . DOI: 10.1016/s0168-9452(01)00585-4
Related News:
Gene Resources:
- NCBI ID: AB059239
- UniProt accessions:
Sequences:
cDNA Sequence
- >LOC_Os10g31460.4 cDNA ATCCCATCCATCCTTGGCTTACTTATCTAGATCAATCACAATGGCTAAGCTTGTGGCTCTTACCTTCGTTGTCTTGGTGAGCATTGGACTAGCCAATGCTGGAAGGGTGGCTAGATATGCTAGTGCAGGCGGTGGCGGCGGTGGAGGGGGAGGTGGCGGTGGGTCAAACGGTGGATCTGGATGGGGATCCGGTTCTGGCTCTGGGTATGGCCAGGCAAGTGGCGGTGGAGCATATGCTAGTGGAGGCGGAGGAGCAGGAGGTGGTGGAGCGTGGACACGACATGGCGGGATCCGGCATACGGTATCCGCGTTCATGGGTCTCGGTTAGTGGACAAGCTGGTGGGTATGGACCATATGGTGGAGGATATGCTCAAGGAGGGGGTGGCGGACAAGGTGGCGGTGGTGGACAAAATGGTGGATCCGGATCTGGGTATGGCTCTGGCTCTGGGTATGGTCAAGCTGGAGGGTATGGGCCGTACGGTGGTGGATATGCTCAGGCCGGTGGCCAAGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGACAGAGCGGTCCTGGTGGCAGCGGGTATGGTAGTGGATCAGGAAGCGGATCTGGAAGTGCGTATGGTGGACACCCATAAAAACATGTAGAATCTAAATAAACTAGCACCACAGGCCATGTGTGCTGATTGCATGTTTGAGAGATGTGTTATTTACGTAAATAATGGGTAATAAAGGGCCTCCGTTGAATACACTGTAATAACAAAATGTACTGGTCATTGTACACCACAATTCTACACAGCCCACCGGTGTAACTAGATGTTTGATCAATACATAGTAGTGTTGACAGTGTTGCGTCATACTTTAAAGTC
- >LOC_Os10g31460.5 cDNA ATCCCATCCATCCTTGGCTTACTTATCTAGATCAATCACAATGGCTAAGCTTGTGGCTCTTACCTTCGTTGTCTTGGTGAGCATTGGACTAGCCAATGCTGGAAGGGTGGCTAGATATGCTAGTGCAGGCGGTGGCGGCGGTGGAGGGGGAGGTGGCGGTGGGTCAAACGGTGGATCTGGATGGGGATCCGGTTCTGGCTCTGGGTATGGCCAGGCAAGTGGCGGTGGAGCATATGCTAGTGGAGGCGGAGGAGCAGGAGGTGGTGGAGCGTGGACACGACATGGCGGGATCCGGCATACGGTATCCGCGTTCATGGGTCTCGGTTAGTGGACAAGCTGGTGGGTATGGACCATATGGTGGAGGATATGCTCAAGGAGGGGGTGGCGGACAAGGTGGCGGTGGTGGACAAAATGGTGGATCCGGATCTGGGTATGGCTCTGGCTCTGGGTATGGTCAAGCTGGAGGGTATGGGCCGTACGGTGGTGGATATGCTCAGGCCGGTGGCCAAGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGACAGAGCGGTCCTGGTGGCAGCGGGTATGGTAGTGGATCAGGAAGCGGATCTGGAAGTGCGTATGGTGGACACCCATAAAAACATGTAGAATCTAAATAAACTAGCACCACAGGCCATGTGTGCTGATTGCATGTTTGAGAGATGTGTTATTTACGTAAATAATGGGTAATAAAGGGCCTCCGTTGAATACACTGTAATAACAAAATGTACTGGTCATTGTACACCACAATTCTACACAGCCCACCGGTGTAACTAGATGTTTGATCAATACATAGTAGTGTTGACAGTGTTGCGTCATACTTTAAAGTC
- >LOC_Os10g31460.2 cDNA ATCCCATCCATCCTTGGCTTACTTATCTAGATCAATCACAATGGCTAAGCTTGTGGCTCTTACCTTCGTTGTCTTGGTGAGCATTGGACTAGCCAATGCTGGAAGGGTGGCTAGATATGCTAGTGCAGGCGGTGGCGGCGGTGGAGGGGGAGGTGGCGGTGGGTCAAACGGTGGATCTGGATGGGGATCCGGTTCTGGCTCTGGGTATGGCCAGGCAAGTGGCGGTGGAGCATATGCTAGTGGAGGCGGAGGAGCAGGAGGTGGTGGAGCGTGGACACGACATGGCGGGATCCGGCATACGGTATCCGCGTTCATGGGTCTCGGTTAGTGGACAAGCTGGTGGGTATGGACCATATGGTGGAGGATATGCTCAAGGAGGGGGTGGCGGACAAGGTGGCGGTGGTGGACAAAATGGTGGATCCGGATCTGGGTATGGCTCTGGCTCTGGGTATGGTCAAGCTGGAGGGTATGGGCCGTACGGTGGTGGATATGCTCAGGCCGGTGGCCAAGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGACAGAGCGGTCCTGGTGGCAGCGGGTATGGTAGTGGATCAGGAAGCGGATCTGGAAGTGCGTATGGTGGACACCCATAAAAACATGTAGAATCTAAATAAACTAGCACCACAGGCCATGTGTGCTGATTGCATGTTTGAGAGATGTGTTATTTACGTAAATAATGGGTAATAAAGGGCCTCCGTTGAATACACTGTAATAACAAAATGTACTGGTCATTGTACACCACAATTCTACACAGCCCACCGGTGTAACTAGATGTTTGATCAATACATAGTAGTGTTGACAGTGTTGCGTCATACTTTAAAGTC
- >LOC_Os10g31460.1 cDNA ATCCCATCCATCCTTGGCTTACTTATCTAGATCAATCACAATGGCTAAGCTTGTGGCTCTTACCTTCGTTGTCTTGGTGAGCATTGGACTAGCCAATGCTGGAAGGGTGGCTAGATATGCTAGTGCAGGCGGTGGCGGCGGTGGAGGGGGAGGTGGCGGTGGGTCAAACGGTGGATCTGGATGGGGATCCGGTTCTGGCTCTGGGTATGGCCAGGCAAGTGGCGGTGGAGCATATGCTAGTGGAGGCGGAGGAGCAGGAGGTGGTGGAGCGTGGACACGACATGGCGGGATCCGGCATACGGTATCCGCGTTCATGGGTCTCGGTTAGTGGACAAGCTGGTGGGTATGGACCATATGGTGGAGGATATGCTCAAGGAGGGGGTGGCGGACAAGGTGGCGGTGGTGGACAAAATGGTGGATCCGGATCTGGGTATGGCTCTGGCTCTGGGTATGGTCAAGCTGGAGGGTATGGGCCGTACGGTGGTGGATATGCTCAGGCCGGTGGCCAAGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGACAGAGCGGTCCTGGTGGCAGCGGGTATGGTAGTGGATCAGGAAGCGGATCTGGAAGTGCGTATGGTGGACACCCATAAAAACATGTAGAATCTAAATAAACTAGCACCACAGGCCATGTGTGCTGATTGCATGTTTGAGAGATGTGTTATTTACGTAAATAATGGGTAATAAAGGGCCTCCGTTGAATACACTGTAATAACAAAATGTACTGGTCATTGTACACCACAATTCTACACAGCCCACCGGTGTAACTAGATGTTTGATCAATACATAGTAGTGTTGACAGTGTTGCGTCATACTTTAAAGTC
CDS Sequence
- >LOC_Os10g31460.4 CDS ATGCTGGAAGGGTGGCTAGATATGCTAGTGCAGGCGGTGGCGGCGGTGGAGGGGGAGGTGGCGGTGGGTCAAACGGTGGATCTGGATGGGGATCCGGTTCTGGCTCTGGGTATGGCCAGGCAAGTGGCGGTGGAGCATATGCTAGTGGAGGCGGAGGAGCAGGAGGTGGTGGAGCGTGGACACGACATGGCGGGATCCGGCATACGGTATCCGCGTTCATGGGTCTCGGTTAGTGGACAAGCTGGTGGGTATGGACCATATGGTGGAGGATATGCTCAAGGAGGGGGTGGCGGACAAGGTGGCGGTGGTGGACAAAATGGTGGATCCGGATCTGGGTATGGCTCTGGCTCTGGGTATGGTCAAGCTGGAGGGTATGGGCCGTACGGTGGTGGATATGCTCAGGCCGGTGGCCAAGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGACAGAGCGGTCCTGGTGGCAGCGGGTATGGTAGTGGATCAGGAAGCGGATCTGGAAGTGCGTATGGTGGACACCCATAA
- >LOC_Os10g31460.5 CDS ATGCTGGAAGGGTGGCTAGATATGCTAGTGCAGGCGGTGGCGGCGGTGGAGGGGGAGGTGGCGGTGGGTCAAACGGTGGATCTGGATGGGGATCCGGTTCTGGCTCTGGGTATGGCCAGGCAAGTGGCGGTGGAGCATATGCTAGTGGAGGCGGAGGAGCAGGAGGTGGTGGAGCGTGGACACGACATGGCGGGATCCGGCATACGGTATCCGCGTTCATGGGTCTCGGTTAGTGGACAAGCTGGTGGGTATGGACCATATGGTGGAGGATATGCTCAAGGAGGGGGTGGCGGACAAGGTGGCGGTGGTGGACAAAATGGTGGATCCGGATCTGGGTATGGCTCTGGCTCTGGGTATGGTCAAGCTGGAGGGTATGGGCCGTACGGTGGTGGATATGCTCAGGCCGGTGGCCAAGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGACAGAGCGGTCCTGGTGGCAGCGGGTATGGTAGTGGATCAGGAAGCGGATCTGGAAGTGCGTATGGTGGACACCCATAA
- >LOC_Os10g31460.2 CDS ATGCTGGAAGGGTGGCTAGATATGCTAGTGCAGGCGGTGGCGGCGGTGGAGGGGGAGGTGGCGGTGGGTCAAACGGTGGATCTGGATGGGGATCCGGTTCTGGCTCTGGGTATGGCCAGGCAAGTGGCGGTGGAGCATATGCTAGTGGAGGCGGAGGAGCAGGAGGTGGTGGAGCGTGGACACGACATGGCGGGATCCGGCATACGGTATCCGCGTTCATGGGTCTCGGTTAGTGGACAAGCTGGTGGGTATGGACCATATGGTGGAGGATATGCTCAAGGAGGGGGTGGCGGACAAGGTGGCGGTGGTGGACAAAATGGTGGATCCGGATCTGGGTATGGCTCTGGCTCTGGGTATGGTCAAGCTGGAGGGTATGGGCCGTACGGTGGTGGATATGCTCAGGCCGGTGGCCAAGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGACAGAGCGGTCCTGGTGGCAGCGGGTATGGTAGTGGATCAGGAAGCGGATCTGGAAGTGCGTATGGTGGACACCCATAA
- >LOC_Os10g31460.1 CDS ATGCTGGAAGGGTGGCTAGATATGCTAGTGCAGGCGGTGGCGGCGGTGGAGGGGGAGGTGGCGGTGGGTCAAACGGTGGATCTGGATGGGGATCCGGTTCTGGCTCTGGGTATGGCCAGGCAAGTGGCGGTGGAGCATATGCTAGTGGAGGCGGAGGAGCAGGAGGTGGTGGAGCGTGGACACGACATGGCGGGATCCGGCATACGGTATCCGCGTTCATGGGTCTCGGTTAGTGGACAAGCTGGTGGGTATGGACCATATGGTGGAGGATATGCTCAAGGAGGGGGTGGCGGACAAGGTGGCGGTGGTGGACAAAATGGTGGATCCGGATCTGGGTATGGCTCTGGCTCTGGGTATGGTCAAGCTGGAGGGTATGGGCCGTACGGTGGTGGATATGCTCAGGCCGGTGGCCAAGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGACAGAGCGGTCCTGGTGGCAGCGGGTATGGTAGTGGATCAGGAAGCGGATCTGGAAGTGCGTATGGTGGACACCCATAA
Protein Sequence
- >LOC_Os10g31460.4 protein MLEGWLDMLVQAVAAVEGEVAVGQTVDLDGDPVLALGMARQVAVEHMLVEAEEQEVVERGHDMAGSGIRYPRSWVSVSGQAGGYGPYGGGYAQGGGGGQGGGGGQNGGSGSGYGSGSGYGQAGGYGPYGGGYAQAGGQGGGGGGGQSGPGGSGYGSGSGSGSGSAYGGHP*
- >LOC_Os10g31460.5 protein MLEGWLDMLVQAVAAVEGEVAVGQTVDLDGDPVLALGMARQVAVEHMLVEAEEQEVVERGHDMAGSGIRYPRSWVSVSGQAGGYGPYGGGYAQGGGGGQGGGGGQNGGSGSGYGSGSGYGQAGGYGPYGGGYAQAGGQGGGGGGGQSGPGGSGYGSGSGSGSGSAYGGHP*
- >LOC_Os10g31460.2 protein MLEGWLDMLVQAVAAVEGEVAVGQTVDLDGDPVLALGMARQVAVEHMLVEAEEQEVVERGHDMAGSGIRYPRSWVSVSGQAGGYGPYGGGYAQGGGGGQGGGGGQNGGSGSGYGSGSGYGQAGGYGPYGGGYAQAGGQGGGGGGGQSGPGGSGYGSGSGSGSGSAYGGHP*
- >LOC_Os10g31460.1 protein MLEGWLDMLVQAVAAVEGEVAVGQTVDLDGDPVLALGMARQVAVEHMLVEAEEQEVVERGHDMAGSGIRYPRSWVSVSGQAGGYGPYGGGYAQGGGGGQGGGGGQNGGSGSGYGSGSGYGQAGGYGPYGGGYAQAGGQGGGGGGGQSGPGGSGYGSGSGSGSGSAYGGHP*