Gene Details:

  • MSU gene ID: None
  • RAPdb gene ID: None
  • Gene Symbol: SNORKEL1
  • Genome: MSU7 ,  IRGSP-1.0
  • Species: Oryza sativa

Functional Descriptions:

  • The products of SNORKEL1 and SNORKEL2 then trigger remarkable internode elongation via gibberellin.
  • Here we show the molecular mechanism of deepwater response through the identification of the genes SNORKEL1 and SNORKEL2, which trigger deepwater response by encoding ethylene response factors involved in ethylene signalling.
  • The ethylene response factors SNORKEL1 and SNORKEL2 allow rice to adapt to deep water.

Literature:

Gene Resources:

  • NCBI ID:
  • UniProt accessions:

Sequences:

cDNA Sequence
  • >LOC_Os01g25720.1 cDNA GGAATTATTTAATGGTCAGGAAAAACGACCAAAAACTAGTATGTATATTGTGCTGCAGTTTCTCCCTTTCATTTTTATGTATGTTGGAATTATTTTTGTTTACACATATCATCTATCCACATGGCCTCCTTCCTGTTAGGACTTCTGAAGCACTGCCAAACTAAAATCTTCAGGATGGCCATAATTGATTGCTTTTGATGATTTCACCCTTATTTTGCTGCGCGTATACGTTTGAATTCTTTTTTTTTTTACTGCTGAGATCTGCATTTAGGCTATTACTAACCATCTCATCAGTGTGTTACGTAGCCACAAAATTCAACTTCTTTTTCAAGGAGTATAGGTACACTGAATTGTGAGAGCGGAACTCATGCAATCAGTTAGCAGCATCGCACCGTTGTAACTTCCTACAATCTTACCATCGATGAAAAACAGAGAAAAAGGGTAGAGATGGCCTACTGTCTTTTTCATAATTTAATGACCTAGATTTTTCATAAAGGCTAAGCACCAGTCCCTACTTTGTTTAGCAGCTTCTGGACATCAATTGCTTGTCAGGTTGGGAATGTAGCGTAATTTACAACGGGTGTTCATTCCCTTTCAAAGTAAGTGGCTAATAATTATATTCAGGATCATGACAAATTGCAACTTGCTGCACACAGCGATGGACAATGACAGCACATTACGCGCACCTTTTCTTCTACCAGTGGAGGTCCATCTTGTACTGATTGATTGGGACGCTGTCCAAGATAAATTGTGGACAGACCCCATTGAACCACCAGTTCCCTCTCCATTTCATTGATATTTGTGTGTAAGCTCTACAATGGGTGAACTGGTGACCAGCATGGTGATCGGGCCACTGGTCCACATGGTGAAGGAGAAGGCTTCCAGCTACCTCCTGGAGCAGTACAAGGTGATGGAAGGCATGGAAGTGCAGCACAAGATCCTCAAGCGCAAGCTGCCGGCCATCTTGGACGTCATCTCTGACGCTGAGAAGCAGGCATCTGAACACAGGGAAGGAGCTAAGGCCTGGCTTGAGGAGCTCAAGGCAGTGGCCTATGAGGCGAATGAAGTCTTCGACGAGTTCAAGTACGAGGCGCTACGGCGTGAAGCCAAGAAGAACGGGCACTACACCAAGCTCGGCATCGATGCGGTAAAACTCTTTCCTACTCACAACCGTGTCGTGTTCCGATACAAGATGGGCAGGAAGCTCTGCCGGATCGTGCAGAATATTGAAGTGCTAGTCGCAGAGATGAATGCCTTTGGGTTTAAATTCGAACCTCAGTCTATAGAGTCCAAGGAATGGAGGCTAACCGATTCTGACATCTTTGACCCAATGAACATTGCTAGCAGATCGAGAGATGAAGATAAGAAGCTGCTCGTTAGCATATTGCTCTCCCAAGCAAGCAATGTAAAACTCGCCGTCCTTCCTATTGTTGGAATGGGAGGGCTAGGCAAAACTACCTTAGCCAAACTCATTTACAATGAGCCTGAAATTCAGAACCATTTCCAGTTGATGATCTGGGTATGTGTGTCTGACAACTTTGATGTTGCGTCTGTTGCTAGAAGTATAGTTGATGCAGTTCCTAAAAAAGGTGATAAAGTAACCATCAATGAAAATCAAACCTCGGCACTTGACGAGCTTCAGAAATTAGTGAGCGGGCAGAGGTATCTCCTTGTATTGGACGATGTTTGGAATAGGGATGATGAAAAATGGCGTAAACTGAAGAAATGCCTCGAACATGGTAGCACTGGTAGTGCAGTGTTAGCAACAACTCGTGAAGGAGGAGTTGCTGAACTAATGCACACAACTGATGCATATAATCTTACTGCTCTAAATAACAGTGTCATTAAGGAAATCATTGACACAGCAGCTTTTAGACCGAAAAAGGAGATCAAGCCCGCTGAGCTAGTTCAAATGGATGATAAGTCATTATTATCTAAAAAGAAGGAAATGATTGATCAGTTTGTGGAGAGATGTGCTGGGTTGCCATTGGCAGCAAAAGCACTAGGTTCTGTACTTTATACCAAGACCAGCCTGGAAGAATGGGAGGCAGTATTAAGAAGCAGCAGTATCTGCACTAAGGAGACTGGAATTTTACCAATACTGAAGCTCAGCTATGACAATTTGCCGTCACATATGAAGCAGTGCTTTGCTTTCTGTGCTATTTTTCCTAAGGATTACGAGATTGATAAGGATCGCAAATGGATTAATCCCAGAAATAAAAGATATCCGCCTTGAAACCACTGGAGAAGGTATTTTCAATGAATTAGCTTCTAGATCTTTCTTTCAGGAGTTGAAGCGAGTCCGATTTGACAAATATAGAAGCAACCATGGGCATTGTTCCAGAATCATATGTAAGATGCACGATCTTATGCATGATGTTGCCACTTCAATTATGGGAAAGGAATGTATCGCTATAACTAAATATCCTACTGAAAGAGGGTCATATTCAAATGCTACTCGCCATCTACTTTTATCATGTGATGATCCAGATAATGTGATGAATGATTATCTGAAAAAAGAATCTCCAGCTATCCAAACACTGCTCTGTGCTGAACCTATTTTCACATCAAGTTCATTGCAACACTCAGCAAAATACAGAGCTGTACGAGCATTGAAACTCGATCAGTGTAGGAGTTTGTTCTTACTTCAGCCAAAGCATCTACATCACTTGAGGTACCTAGATCTCTCAGAAAGTGATATCAGAGTACTTCCTGACGATATAAGTATCCTATACTGTCTACGAACTTTGAACCTTTCTGACTGCAGTGATCTCTATCGACTTCCAAAACAAATGAAGTACATGACAGCCCTCTGTCACCTCCACACTCATGGATGTACAAGTTTGAAGCACATGCCTCCAGATTTGGGAAAACTCACTTCCTTACAAACACTCACTTGTTTTGTAGCTGGTACTGGCTCTGGTTGCAGTAATGTCGGAGAGCTACAACATTTAGATATCAGCGGTCAACTAGAGCTACGTCAGATGGAAAATGTTAACGAGGAAGATGCAAGACTGATGAAACTTGAAAACAAGAAGCTCTCAACACTTTCTTTAGTATGGAATGAAAATGACAAAGAAGATCGATCTTACACCAATGCATCAGATTGTCATGAGAAGGTGATCGAAGCTCTCAAACCTCATGATGAGCTTCGCGTTCTGAATGTCAAATCCTGCAAGAGCTCATCTTTCCCATCATGGATGGGTATGCTTAAACGCCTTGTAGAGATTGATCTAGATAATTGTACAATGTGCCAAAATATTCCTTCAGTTTTGGCAGCTACAAGATCTTCAAGTTCTTCGGCTGGATGGATTCCATGGACTGCAGTATTTGTGCAGCATTGGTCAAAACAGTGAGATACCGTCAACATTCCCAAAACTAAAAGAGCTTAAACTAACAAACTTGAAGAGTTTCAACCGATGGTGGGAAATAAATGAGAGACAAGAAAAGCTTGATTTTCCTCAGCTTGAGAAGCTGGTTATTAAGGGATGTGGAGAGCTAACATCACTGCCTACTAGTGACAGTAATATGTCAGAGCCTGCATTACCAGCTTTAAAGGAACTCGAACTCTGTGATTTAAATCAATTCGAGAGATGGCAGGCAGCGGAAGGAACACAAGACAAACCACCGACCTTCCCTAACCTTGAGAACATTAGTATTGTGAAATGTCCAGAGTTGACAAGTCTACCAGAAGCACCAAAGCTCAGTGTGTTAGACATAGGAAATGGCTCTGAACAGATGCTCCTTTGCATACCTAGATACATGGCTTCATTGTCCACTCTGAGATTGCAGCATGAAGGTGAAGAAACAACACCTCTAACTGAACGCTTTTTGATTGAGTGGGTGGATGGCAAGGACAATCAGAATCGTGAGTACCCTTTGCCAGTTATGAAGCTAGTTGGCTTCAACGTGTTCTTCCGTTCAGGTGCACAAGCACTATGGGCATGCTTTGCACAGCTTAAAGATTTGGTAATTATTAGTTGTGATGGTCTCATCCACTGGCCAGAGAGAGAATTTCAGAGCTTGGTAGCCTTGAGGACATTAGTGATACAGCGATGCAGCAAACTGAAGGGATTCTCGCCACAAGCTCTTGAGCAGTCAACATCAGGAAGGGAGATACTCCTGCCACGTCTGGAGTCACTATCAATACATGAATGTGAAAGTTTGGTAGAGATCTTCAACGCCCCACCATCTCTCAAGGAAATGGACATAGACGACAACCCTAAGCTTGAGTCGATATTCGGCCAGCAGAGACACGGGCCAGCAGGGCCTTGCAGCGACAACATTGTGTCTGCTGTTGCGTTGGAACCATCATCACCAGCTGGGGACCGCTTCTCTCCTCCTGAATCACTGGAGTCTCACTCGGGCGAGCTCCCTTCGTTGGTACAACTCAATCTCCACCACTGCAAAAGCCTGGCATCGCTACAAGATTCACCGCAAGCATACTCATCCCTCCAACAGCTTATCATTAATGAATGCCCTGCTCTAAAAGTGCTCCCTACATGCCTGCGGCAACAGCTGCCCAGCCTCAAGCGGAAATATCTAGACGCCCATCATGAAGGTACGCAATAATTTCTTTATTCCCATAACGAAGCGAATTCGATCAATCCCCCGTGTATTTTGTCATTTTTATCCCATTATACCACTCTATTGTTCCAACTTGTTCAGATATCCTAGGCTGAACTATTTTAGGCATCTACAGGTAATCAATCCAAAGATATGTAAGTGCTTATAAAAGTTTCAAGCTCGTGAAAAACAGATAAATGCAGAGAAACTAGTCAATAGTAAAAGGAGCAGTCAGAATTATAGAATAGAATGACGAGTACTGCTGAAAAAAATCCCAAGAAGGGAATATTCCTTTACCTAAAAACTCGTTTTTTATTTAGTAGTGTTCACTTCAATACTCCTCTTTACATATAGCACGGATTTAAGCCAAATTCCTCTATCAATGACTAGGGGATAAATTAGTTCTAACAATTGATTAGTGCTTATATTTGACA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  • >LOC_Os01g25720.2 cDNA 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CDS Sequence
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Protein Sequence
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